More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0201 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0201  glycosyl hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
392 aa  811    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0179492  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0152  glycosyl transferase, group 1  86.23 
 
 
335 aa  599  1e-170  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.151693  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_189  glycosyltransferase domain protein  83.53 
 
 
335 aa  581  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0117061  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2798  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
373 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
426 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
446 aa  63.2  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
396 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  23.3 
 
 
399 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  22.95 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
436 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  23.36 
 
 
377 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  27.99 
 
 
401 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0120  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 
325 aa  60.1  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 
378 aa  60.1  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
351 aa  59.7  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
371 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
457 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  27.6 
 
 
392 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  24.12 
 
 
377 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1635  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
623 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030735  normal  0.881168 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
410 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4068  group 1 glycosyl transferase  26.62 
 
 
501 aa  57  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.736051  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
376 aa  57.4  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
377 aa  57  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  23.49 
 
 
378 aa  56.6  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  23.21 
 
 
378 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  29.03 
 
 
349 aa  56.6  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
392 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 
391 aa  56.2  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  27.54 
 
 
375 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
391 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  22 
 
 
377 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  23.81 
 
 
385 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  21.27 
 
 
382 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  21.73 
 
 
381 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  22 
 
 
377 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  22.38 
 
 
382 aa  54.7  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  22.11 
 
 
358 aa  54.7  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2839  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
410 aa  53.9  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000929043  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  20.71 
 
 
382 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
389 aa  54.3  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  23.24 
 
 
378 aa  54.3  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 
392 aa  53.9  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 
370 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
396 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1675  glycosyl transferase, group 1  23.45 
 
 
366 aa  53.9  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.447182  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 
344 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 
389 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 
403 aa  53.5  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
394 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 
394 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 
394 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 
394 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  21.13 
 
 
377 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  19.94 
 
 
377 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  22.31 
 
 
421 aa  53.1  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1077  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 
325 aa  53.1  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.508973  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2615  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.72 
 
 
394 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4911  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
394 aa  53.1  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527182  hitchhiker  0.000729533 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  22.92 
 
 
361 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0659  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
379 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 
381 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1322  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
342 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580469  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
378 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  23.04 
 
 
404 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
415 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
360 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
394 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
386 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0308  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 
364 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429385  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1092  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
374 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  28.72 
 
 
394 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11940  glycosyltransferase  24.89 
 
 
367 aa  51.6  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0997293  normal  0.0817193 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03941  putative glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 
421 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  21.89 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  20.12 
 
 
373 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
406 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  23.77 
 
 
406 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 
374 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 
413 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  26.6 
 
 
405 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 
402 aa  52.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 
344 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.19 
 
 
390 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.89 
 
 
360 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2477  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.72 
 
 
394 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04171  putative glycosyl transferase, group 1  24.24 
 
 
388 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.116045  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  20.12 
 
 
377 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2027  glycosyl transferase, group 1  22.4 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 
387 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
412 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  26.27 
 
 
375 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0960  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
345 aa  51.2  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  23.27 
 
 
382 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>