More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0659 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0659  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
379 aa  783    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100835  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1055  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
372 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
390 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
379 aa  93.2  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  23.26 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 
367 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13771  hypothetical protein  22.64 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0960  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  28.23 
 
 
393 aa  77  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
357 aa  75.9  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 
406 aa  75.9  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
364 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  21.37 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
436 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0941  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
325 aa  72.8  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.018842  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03941  putative glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
421 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0393  putative glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 
388 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.336091  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.74 
 
 
379 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  24.69 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  28.45 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  23.46 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  23.74 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  27.01 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2865  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04591  putative glycosyl transferase, group 1  23.87 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  26.6 
 
 
476 aa  69.7  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 
417 aa  69.7  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1322  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
342 aa  68.9  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  22.19 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0132  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 
359 aa  69.3  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00903136  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
377 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  34.04 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1997  glycosyl transferase group 1  24.01 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.336344 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1131  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  36.03 
 
 
389 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 
394 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3816  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4278  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.25 
 
 
379 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54539  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2100  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
400 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  30.26 
 
 
413 aa  67  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  25 
 
 
430 aa  67  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
381 aa  67  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
396 aa  67  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  29.62 
 
 
455 aa  67  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1086  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0607003  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0696  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.53 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  30.47 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 
390 aa  66.2  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
453 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  28.03 
 
 
450 aa  66.2  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.64 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
346 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
406 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1077  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.508973  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0461  lipopolysaccharide biosynthesis-related protein  20.94 
 
 
383 aa  65.9  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00755363  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12629  alpha-mannosyltransferase pimA  24.75 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1224  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 
372 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3994  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  25.27 
 
 
381 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 
424 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 
405 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04171  putative glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
388 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.116045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  27.53 
 
 
374 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
399 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 
899 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  21.94 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  27.93 
 
 
358 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14970  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.53 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0993  putative cell division protease FtsH-like protein  28.96 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  26.25 
 
 
373 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
377 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 
413 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  24.52 
 
 
382 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
406 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>