More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6395 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
390 aa  782    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1055  glycosyl transferase group 1  38.67 
 
 
372 aa  222  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0659  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
379 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100835  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  24.28 
 
 
396 aa  120  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12220  glycosyltransferase  33.03 
 
 
432 aa  110  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.296579  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
448 aa  107  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  33.23 
 
 
436 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.81 
 
 
390 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
381 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 
348 aa  98.6  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  25 
 
 
372 aa  95.9  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
411 aa  95.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 
386 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
395 aa  93.6  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
390 aa  93.2  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  22.64 
 
 
392 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 
402 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  31.53 
 
 
431 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 
387 aa  92.4  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  29.16 
 
 
381 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  28.35 
 
 
424 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 
810 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  29.97 
 
 
420 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
396 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  30.03 
 
 
413 aa  90.9  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
391 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  24.16 
 
 
369 aa  90.5  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1120  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
386 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.233547  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
435 aa  90.1  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  22.54 
 
 
374 aa  90.1  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
399 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
404 aa  89.7  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  26.4 
 
 
393 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
448 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  27 
 
 
401 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  27.01 
 
 
415 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.15 
 
 
377 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
385 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
437 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
437 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
430 aa  87.4  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  24 
 
 
423 aa  87.4  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
372 aa  87.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  23.21 
 
 
397 aa  87  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.89 
 
 
385 aa  87  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3920  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
372 aa  87  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
367 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 
381 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  25.89 
 
 
389 aa  86.7  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.12 
 
 
408 aa  86.7  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 
422 aa  86.3  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 
405 aa  86.3  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
425 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6015  GumH protein  29.09 
 
 
397 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  36.16 
 
 
386 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  31.18 
 
 
417 aa  85.5  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0580  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
391 aa  85.5  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
407 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  26.56 
 
 
443 aa  84.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  30.86 
 
 
402 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  24.54 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 
403 aa  84.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  34.42 
 
 
381 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
412 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 
389 aa  84  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
439 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
439 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
458 aa  84  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  28.73 
 
 
480 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1775  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.28 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748025 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
398 aa  83.2  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  28.54 
 
 
438 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  31.75 
 
 
389 aa  83.2  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 
434 aa  83.2  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
412 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
383 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  28.14 
 
 
466 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  28.47 
 
 
438 aa  82.4  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 
357 aa  82.8  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
416 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
370 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 
438 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 
396 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  30.61 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
438 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  22.84 
 
 
424 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 
410 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5607  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
428 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
387 aa  82  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
405 aa  81.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>