More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1354 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
382 aa  757    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  58.89 
 
 
377 aa  403  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  55.82 
 
 
388 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  55.29 
 
 
388 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  55.29 
 
 
388 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  55.03 
 
 
388 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0552  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  54.23 
 
 
388 aa  385  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.284297  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  54.5 
 
 
388 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  54.5 
 
 
388 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1964  glycosyl transferase group 1  53.58 
 
 
388 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  53.85 
 
 
388 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2267  glycosyl transferase, group 1  53.97 
 
 
388 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370121  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  54.23 
 
 
385 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2476  glycosyl transferase, group 1 family protein  54.76 
 
 
388 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0909  HepB protein  54.76 
 
 
388 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2614  glycosyl transferase, group 1 family protein  54.5 
 
 
388 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.419161  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2521  putative glycosyl transferase, group 1  51.32 
 
 
385 aa  346  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329961  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  48.01 
 
 
398 aa  334  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  37.7 
 
 
389 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3112  group 1 glycosyl transferase  38.24 
 
 
390 aa  256  6e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1579  glycosyl transferase group 1  40.82 
 
 
358 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.12364  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 
396 aa  126  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
410 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  39.66 
 
 
404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 
401 aa  120  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  34.64 
 
 
409 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 
415 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  32.7 
 
 
446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 
408 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  28.26 
 
 
382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  28.1 
 
 
360 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
421 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 
438 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 
384 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
399 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  31.63 
 
 
439 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  31.63 
 
 
439 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 
439 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 
382 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  21.64 
 
 
359 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  34.03 
 
 
770 aa  104  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
419 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
360 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
376 aa  103  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
395 aa  103  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
390 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
411 aa  101  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  26.52 
 
 
401 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  25.52 
 
 
358 aa  100  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  36.51 
 
 
443 aa  99.8  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 
438 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
390 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  34.98 
 
 
415 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
438 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
414 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  33.02 
 
 
386 aa  98.2  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3898  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
433 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
394 aa  97.4  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
409 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
411 aa  97.1  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 
382 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
391 aa  97.1  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  36.32 
 
 
370 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
377 aa  96.7  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
405 aa  96.7  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 
414 aa  96.3  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
386 aa  96.3  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  34.93 
 
 
384 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  36.1 
 
 
385 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
395 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 
405 aa  95.1  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 
426 aa  94.7  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0562  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
368 aa  94.7  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
355 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 
395 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
419 aa  94.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
378 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
422 aa  94  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
464 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
371 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  35.89 
 
 
389 aa  93.2  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  27.96 
 
 
417 aa  93.2  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 
440 aa  92.8  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
391 aa  92.8  9e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
398 aa  92.8  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
434 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 
381 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
398 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  35.2 
 
 
373 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
453 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  31.56 
 
 
421 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  22.31 
 
 
536 aa  91.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  30.38 
 
 
423 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  32.85 
 
 
386 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 
440 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 
373 aa  90.9  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>