More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2587 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
387 aa  801    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  33.69 
 
 
398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  36.56 
 
 
373 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
375 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
368 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  36.1 
 
 
400 aa  190  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  35.42 
 
 
367 aa  189  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 
394 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 
370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
370 aa  178  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
370 aa  177  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  33.98 
 
 
365 aa  170  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  31 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  29.78 
 
 
421 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  28.14 
 
 
379 aa  144  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  28.26 
 
 
399 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  29.16 
 
 
380 aa  137  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
411 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  27.47 
 
 
395 aa  119  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1005  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
357 aa  108  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.105019  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 
346 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
374 aa  106  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 
353 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
371 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 
369 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  23.76 
 
 
365 aa  101  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  25.62 
 
 
380 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
380 aa  97.4  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 
360 aa  95.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  24.42 
 
 
392 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16220  hypothetical protein  24.86 
 
 
368 aa  90.5  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  30.57 
 
 
370 aa  90.1  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
379 aa  89.4  9e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  24.54 
 
 
411 aa  89  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  22.6 
 
 
396 aa  88.6  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
356 aa  88.2  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 
394 aa  87.8  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 
389 aa  86.3  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0727  glycosyl transferase, group 1  24.61 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0832639  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2374  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
373 aa  85.9  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997519 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
391 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 
372 aa  83.6  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  24.33 
 
 
352 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54068  n-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  24.23 
 
 
450 aa  82.4  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.15052  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 
365 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  23.94 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1120  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 
386 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.233547  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  28.27 
 
 
372 aa  82  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2541  group 1 glycosyl transferase  25.72 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.433843  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.65 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  24.13 
 
 
351 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.8 
 
 
393 aa  80.1  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5357  hypothetical protein  26.4 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
385 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  27.16 
 
 
395 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  26.71 
 
 
397 aa  79  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 
419 aa  79.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 
391 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  26.62 
 
 
476 aa  79  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.05 
 
 
375 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2013  glycosyltransferase, RfaG  21.92 
 
 
368 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  27.53 
 
 
392 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  28.62 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
373 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
351 aa  77  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 
363 aa  77  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  22.93 
 
 
372 aa  77  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 
395 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.26 
 
 
402 aa  76.3  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.77 
 
 
385 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  26.73 
 
 
384 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4615  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.352309  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  29.47 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  34.04 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  25.51 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.72 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  22.51 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
397 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00636  hypothetical protein similar to phosphatidylinositol:UDP-GlcNAc transferase PIG-A (Broad)  22.42 
 
 
488 aa  74.7  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0909226  normal  0.40959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1775  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.68 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748025 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1345  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2345  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  22.8 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 
373 aa  73.6  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>