More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1346 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  80.7 
 
 		 396 aa  654    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 399 aa  807    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  53.25 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  37.92 
 
 		 387 aa  252  8.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  35.17 
 
 		 390 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  30.71 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  36.56 
 
 		 379 aa  199  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  28.72 
 
 		 384 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  34.75 
 
 		 408 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  35.98 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  34.66 
 
 		 387 aa  189  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 379 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  32.63 
 
 		 391 aa  172  9e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  31.27 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 396 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 		 378 aa  163  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 		 382 aa  159  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 		 390 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 		 403 aa  156  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  30.75 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 		 378 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  26.96 
 
 		 371 aa  150  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 		 378 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 		 394 aa  149  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 		 378 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 		 376 aa  149  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 		 378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 		 376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  28.46 
 
 		 371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  30.42 
 
 		 371 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.7 
 
 		 380 aa  145  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  29.7 
 
 		 377 aa  145  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  32.13 
 
 		 378 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  32.13 
 
 		 378 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 		 378 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 		 378 aa  144  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  32.52 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  25.85 
 
 		 371 aa  140  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  30.71 
 
 		 371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.47 
 
 		 341 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5390  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.02 
 
 		 378 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.02 
 
 		 378 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.02 
 
 		 385 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.02 
 
 		 385 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.02 
 
 		 385 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.02 
 
 		 385 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.02 
 
 		 385 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.3 
 
 		 378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 		 372 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 		 374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1064  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.289195  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 		 373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  30.77 
 
 		 374 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  26.89 
 
 		 370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2649  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 		 381 aa  130  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.41535  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.35 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 		 371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 		 386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 		 382 aa  127  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 		 376 aa  126  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  24.7 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 		 385 aa  123  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  31.44 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  25 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2188  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 		 411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.891642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  34.37 
 
 		 374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 		 375 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 		 383 aa  119  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 		 392 aa  120  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1919  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 		 407 aa  119  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854337 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  23.45 
 
 		 375 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0297  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 		 371 aa  119  9e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  31.16 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 		 385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 		 389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  24.7 
 
 		 376 aa  117  5e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  24.7 
 
 		 376 aa  116  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3483  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0885784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>