More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4263 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  80.7 
 
 
399 aa  654    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
396 aa  798    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  51.95 
 
 
398 aa  376  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  37.28 
 
 
387 aa  242  7.999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  36.22 
 
 
390 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  31.5 
 
 
383 aa  213  4.9999999999999996e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  36.73 
 
 
379 aa  202  7e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  28.91 
 
 
384 aa  199  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  36.45 
 
 
390 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 
408 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 
387 aa  182  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
378 aa  180  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 
394 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
391 aa  170  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
396 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 
382 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 
376 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 
378 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 
378 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 
388 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
378 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
376 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 
382 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.62 
 
 
341 aa  150  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 
403 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  31.09 
 
 
378 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 
378 aa  150  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  34.75 
 
 
388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  31.69 
 
 
378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  31.69 
 
 
378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  30.61 
 
 
371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 
378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 
382 aa  146  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.8 
 
 
380 aa  145  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  28.8 
 
 
377 aa  145  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  31.2 
 
 
382 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5390  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 
384 aa  143  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
394 aa  143  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
387 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.33 
 
 
378 aa  143  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
381 aa  142  8e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  27.99 
 
 
374 aa  142  9e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.78 
 
 
378 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.78 
 
 
385 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.78 
 
 
378 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.78 
 
 
385 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.78 
 
 
385 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.78 
 
 
385 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.78 
 
 
385 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  24.8 
 
 
371 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2649  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 
381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.41535  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.54 
 
 
377 aa  136  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
371 aa  133  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  26.63 
 
 
371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  28.31 
 
 
371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 
379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
373 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 
381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 
372 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
385 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
408 aa  126  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 
366 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  34.82 
 
 
376 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1064  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
369 aa  125  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.289195  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 
339 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
383 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  26.3 
 
 
370 aa  124  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3483  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 
385 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0885784 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2188  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
411 aa  124  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.891642  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  22.59 
 
 
378 aa  123  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  33.23 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
385 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  32.78 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  24.42 
 
 
375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
377 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 
389 aa  121  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
382 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1919  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 
407 aa  119  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.854337 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  25.76 
 
 
369 aa  119  9e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  34.28 
 
 
393 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  32.45 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  23.53 
 
 
376 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
369 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  24.54 
 
 
371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  34.23 
 
 
382 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
384 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  30.68 
 
 
374 aa  116  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.65 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 
361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>