More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1276 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
387 aa  781    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  43.05 
 
 
379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  37.92 
 
 
399 aa  264  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  37.28 
 
 
396 aa  257  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  34.21 
 
 
384 aa  253  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  34.4 
 
 
398 aa  204  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  35.39 
 
 
390 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  34.32 
 
 
394 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  34.19 
 
 
376 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  33.52 
 
 
378 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 
378 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 
385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  32.87 
 
 
391 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
390 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 
387 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 
387 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5390  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 
384 aa  142  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
396 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0495  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
387 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
379 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  26.72 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4413  glycosyl transferase group 1  34.58 
 
 
394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  29.09 
 
 
371 aa  132  9e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 
376 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  34.38 
 
 
388 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.39 
 
 
377 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
377 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
385 aa  122  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  29.68 
 
 
371 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 
381 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 
392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0297  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 
371 aa  119  9e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  31.81 
 
 
382 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 
379 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 
372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  30.05 
 
 
371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
381 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
378 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
378 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
374 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  29.22 
 
 
382 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  33.44 
 
 
392 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  29.08 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  27.63 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.63 
 
 
380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  30.75 
 
 
389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.04 
 
 
378 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
382 aa  113  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
403 aa  113  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
379 aa  112  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
404 aa  112  9e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.25 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
384 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1064  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 
369 aa  111  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.289195  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 
387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
378 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.79 
 
 
378 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
371 aa  110  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.79 
 
 
378 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  29.71 
 
 
401 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.79 
 
 
385 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.79 
 
 
385 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.79 
 
 
385 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.79 
 
 
385 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.79 
 
 
385 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
390 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  33.43 
 
 
371 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  25.35 
 
 
376 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
384 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 
385 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  33 
 
 
401 aa  107  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  33.99 
 
 
411 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
373 aa  106  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
385 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  31.7 
 
 
403 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
386 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
387 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  25.76 
 
 
369 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
388 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  24.46 
 
 
370 aa  103  6e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  24.86 
 
 
376 aa  102  8e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  29.68 
 
 
374 aa  102  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
383 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  25.14 
 
 
376 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
403 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
364 aa  101  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  26.34 
 
 
371 aa  101  3e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
387 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
377 aa  100  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  29.62 
 
 
370 aa  100  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>