More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1267 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  100 
 
 
376 aa  763    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  94.95 
 
 
376 aa  724    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  97.61 
 
 
376 aa  746    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  60.7 
 
 
375 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  48.81 
 
 
371 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  49.47 
 
 
371 aa  330  2e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  47.62 
 
 
371 aa  327  3e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  45.5 
 
 
370 aa  302  7.000000000000001e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
387 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  30.03 
 
 
374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
396 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.5 
 
 
380 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  29.5 
 
 
377 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
390 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
404 aa  166  8e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.92 
 
 
377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 
374 aa  163  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 
383 aa  161  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
394 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
378 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 
372 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
382 aa  160  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 
378 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 
378 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
378 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
378 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 
378 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.59 
 
 
341 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 
381 aa  155  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 
388 aa  153  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
387 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
378 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
382 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  27.27 
 
 
382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 
375 aa  146  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
382 aa  145  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 
384 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
373 aa  142  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  27.88 
 
 
378 aa  142  8e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.61 
 
 
377 aa  142  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.46 
 
 
378 aa  142  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.46 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.46 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.46 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.46 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.46 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.46 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.46 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 
376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
408 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
381 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
382 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 
371 aa  134  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 
379 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
373 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  27 
 
 
371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
385 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  29.39 
 
 
598 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  24.02 
 
 
381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
386 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 
379 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 
381 aa  119  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  28.82 
 
 
377 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 
390 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  28.24 
 
 
377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  25.27 
 
 
371 aa  117  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 
399 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.09 
 
 
377 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
396 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 
379 aa  106  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  23.32 
 
 
362 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
339 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 
403 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  24.78 
 
 
384 aa  102  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
385 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  23.34 
 
 
398 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 
382 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 
389 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 
387 aa  96.7  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
378 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
387 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  25.22 
 
 
374 aa  89.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0851  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
416 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
390 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 
377 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2649  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 
381 aa  87  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.41535  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 
361 aa  86.7  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
387 aa  86.3  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
408 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  27.13 
 
 
383 aa  85.5  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
423 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.38 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5353  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  27.2 
 
 
369 aa  83.2  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
385 aa  83.2  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>