More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5372 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
372 aa  754    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  62.67 
 
 
374 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  49.07 
 
 
384 aa  323  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  47.7 
 
 
404 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  42.74 
 
 
383 aa  292  5e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  44.66 
 
 
408 aa  292  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  45.26 
 
 
598 aa  291  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  44.59 
 
 
373 aa  287  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  42.74 
 
 
371 aa  285  5.999999999999999e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  43.24 
 
 
379 aa  279  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  42.7 
 
 
373 aa  280  4e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  41.69 
 
 
382 aa  272  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  42.05 
 
 
381 aa  272  6e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  43.21 
 
 
371 aa  272  8.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.86 
 
 
385 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.86 
 
 
385 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.86 
 
 
385 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.86 
 
 
385 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.86 
 
 
378 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.86 
 
 
378 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.86 
 
 
385 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.31 
 
 
378 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  42.19 
 
 
378 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  41.37 
 
 
378 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  42.19 
 
 
378 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  41.1 
 
 
378 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  40.49 
 
 
390 aa  249  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  41.64 
 
 
378 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  41.64 
 
 
378 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  41.64 
 
 
378 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.46 
 
 
377 aa  246  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  41 
 
 
382 aa  245  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  38.44 
 
 
387 aa  242  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  40.72 
 
 
382 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  34.13 
 
 
374 aa  239  4e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  35.62 
 
 
375 aa  237  3e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  39.52 
 
 
382 aa  236  4e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.09 
 
 
380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  37.09 
 
 
377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 
382 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  37.77 
 
 
381 aa  230  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  34.22 
 
 
381 aa  228  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  35.5 
 
 
388 aa  222  9e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  39.28 
 
 
376 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  39.78 
 
 
379 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  36.53 
 
 
396 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  38.55 
 
 
381 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 
371 aa  196  6e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  36.64 
 
 
387 aa  193  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.14 
 
 
377 aa  193  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 
394 aa  189  5.999999999999999e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.62 
 
 
341 aa  188  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
369 aa  182  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
362 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  32.51 
 
 
385 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  37.77 
 
 
386 aa  176  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  31.75 
 
 
378 aa  175  9e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  29.5 
 
 
376 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  29.77 
 
 
376 aa  169  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  29.62 
 
 
376 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  44.59 
 
 
339 aa  166  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 
390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  31.83 
 
 
371 aa  159  7e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 
379 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  37 
 
 
374 aa  158  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
375 aa  142  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  29.78 
 
 
371 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  29.34 
 
 
371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  26.42 
 
 
375 aa  137  4e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  27.35 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  28.06 
 
 
383 aa  134  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.78 
 
 
377 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  32.83 
 
 
403 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  35.16 
 
 
385 aa  123  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  26.27 
 
 
377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  26.27 
 
 
377 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  34.92 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 
382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2649  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.41535  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  40.43 
 
 
148 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 
387 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  33.55 
 
 
389 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
379 aa  112  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5353  glycosyl transferase group 1  35.45 
 
 
379 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5046  glycosyl transferase group 1  36.34 
 
 
379 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  33.79 
 
 
346 aa  92  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1182  putative glycosyl transferase  54.43 
 
 
79 aa  92  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.202119  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  39.33 
 
 
396 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
379 aa  89.4  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
408 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 
364 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  34.5 
 
 
381 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 
379 aa  86.7  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  33.95 
 
 
398 aa  86.7  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  28.2 
 
 
403 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  33.92 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>