More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0610 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
404 aa  814    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  47.7 
 
 
372 aa  302  6.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  43.24 
 
 
382 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  45.72 
 
 
384 aa  299  7e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  41.46 
 
 
383 aa  298  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  42.47 
 
 
371 aa  296  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  45.72 
 
 
374 aa  296  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  43.58 
 
 
373 aa  293  4e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  41.78 
 
 
381 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  43.13 
 
 
408 aa  285  7e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  41.18 
 
 
373 aa  280  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  43.78 
 
 
598 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  40.81 
 
 
371 aa  269  7e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  40.72 
 
 
377 aa  268  1e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.72 
 
 
380 aa  268  1e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  37.14 
 
 
375 aa  267  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  42.56 
 
 
382 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  42.7 
 
 
378 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  36.27 
 
 
374 aa  264  2e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  42.42 
 
 
378 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  41.32 
 
 
378 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  41.87 
 
 
378 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  41.51 
 
 
390 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  41.67 
 
 
378 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.46 
 
 
385 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.46 
 
 
385 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.46 
 
 
385 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  41.6 
 
 
378 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  41.6 
 
 
378 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.46 
 
 
385 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.46 
 
 
385 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  38.01 
 
 
379 aa  257  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.11 
 
 
378 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.11 
 
 
378 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  39.62 
 
 
382 aa  255  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.11 
 
 
378 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  38.86 
 
 
382 aa  247  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 
382 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  41.38 
 
 
381 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  39.19 
 
 
387 aa  239  8e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  40.45 
 
 
381 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  39.78 
 
 
376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
381 aa  230  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.81 
 
 
377 aa  227  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 
388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  37.95 
 
 
379 aa  219  6e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 
396 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  37.47 
 
 
385 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  37.36 
 
 
386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.32 
 
 
341 aa  217  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  36.39 
 
 
387 aa  215  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
369 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 
394 aa  205  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  32.9 
 
 
390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  34.02 
 
 
371 aa  200  3e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  31.09 
 
 
378 aa  186  8e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 
379 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  37.01 
 
 
374 aa  176  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.94 
 
 
377 aa  176  9e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  31.44 
 
 
371 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  30.17 
 
 
371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  44.74 
 
 
339 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
362 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  30.09 
 
 
370 aa  169  1e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  26.59 
 
 
376 aa  166  8e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  28.03 
 
 
371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  26.72 
 
 
376 aa  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
375 aa  163  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  26.01 
 
 
376 aa  159  6e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  29.57 
 
 
383 aa  149  7e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  27.5 
 
 
375 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
390 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
385 aa  143  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 
396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
399 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  35.31 
 
 
382 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  27.44 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.12 
 
 
377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  27.44 
 
 
377 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 
389 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  41.13 
 
 
148 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  30.64 
 
 
403 aa  127  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  34.35 
 
 
387 aa  126  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2649  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.41535  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  26.05 
 
 
346 aa  111  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
408 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
387 aa  103  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
379 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
364 aa  100  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  31.27 
 
 
413 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.65 
 
 
356 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  35.98 
 
 
409 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
414 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  22.49 
 
 
364 aa  97.4  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 
390 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 
409 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>