More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0362 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  100 
 
 
598 aa  1218    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  48.52 
 
 
373 aa  316  7e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  49.73 
 
 
374 aa  315  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  47.37 
 
 
381 aa  310  5e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  43.78 
 
 
371 aa  309  8e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  46.91 
 
 
384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  44.69 
 
 
373 aa  298  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  45.41 
 
 
382 aa  296  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  45.26 
 
 
372 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  43.78 
 
 
404 aa  283  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  39.1 
 
 
383 aa  282  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  38.3 
 
 
379 aa  281  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  41.98 
 
 
408 aa  281  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  44.12 
 
 
371 aa  270  4e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  43.28 
 
 
381 aa  266  7e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0636  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  61.11 
 
 
207 aa  260  6e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.678977  normal  0.34007 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1934  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  61.46 
 
 
199 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3256  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  57 
 
 
207 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2726  sugar transferase  62.05 
 
 
197 aa  253  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1126  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  58.16 
 
 
201 aa  249  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0875109  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  36.9 
 
 
374 aa  246  9.999999999999999e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2000  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  61.14 
 
 
215 aa  246  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  38.26 
 
 
382 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4262  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  60.71 
 
 
206 aa  242  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  37.8 
 
 
381 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1698  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  56.41 
 
 
204 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.965123  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3821  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  57.65 
 
 
206 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3034  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  59.49 
 
 
197 aa  241  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104666  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  41.71 
 
 
378 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  41.71 
 
 
378 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0586  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  53.33 
 
 
206 aa  236  6e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  41.16 
 
 
378 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1345  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  60.2 
 
 
206 aa  235  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.940885 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  41.71 
 
 
378 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02342  glycosyl transferase transmembrane protein  63.08 
 
 
203 aa  234  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0378569 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.36 
 
 
378 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.36 
 
 
378 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.36 
 
 
385 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.36 
 
 
385 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.36 
 
 
385 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  41.92 
 
 
378 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.36 
 
 
385 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.36 
 
 
385 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  42.27 
 
 
378 aa  233  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3389  sugar transferase  54.87 
 
 
204 aa  230  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.251832  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.08 
 
 
378 aa  229  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  36.07 
 
 
375 aa  228  3e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0574  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  56.06 
 
 
200 aa  227  6e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.2884  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4005  sugar transferase  58.16 
 
 
206 aa  226  8e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1664  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  55.9 
 
 
199 aa  224  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0384  sugar transferase  56.92 
 
 
202 aa  224  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  39.73 
 
 
378 aa  224  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0450  Cpp29  52.82 
 
 
201 aa  224  4.9999999999999996e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5365  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  57.95 
 
 
205 aa  223  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1211  putative sugar transferase  53.85 
 
 
201 aa  223  9.999999999999999e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0716  sugar transferase  53.61 
 
 
207 aa  221  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5256  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  57.14 
 
 
204 aa  221  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2648  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  54.31 
 
 
200 aa  220  6e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679598  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30050  sugar transferase family protein  63.08 
 
 
198 aa  220  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0103418  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5254  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  54.55 
 
 
207 aa  217  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  39.94 
 
 
382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0494  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  53.5 
 
 
219 aa  214  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3644  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  53.2 
 
 
217 aa  214  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.212728  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0038  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  60.36 
 
 
210 aa  212  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2483  sugar transferase  51.28 
 
 
219 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  39.38 
 
 
382 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1529  putative YVfC-like sugar transferase  59.34 
 
 
226 aa  208  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 
369 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1141  general glycosylation pathway protein  49.49 
 
 
200 aa  208  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.987369  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  33.95 
 
 
377 aa  207  4e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0597  general glycosylation pathway protein  50 
 
 
200 aa  207  5e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1266  general glycosylation pathway protein  48.99 
 
 
200 aa  206  7e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  39.19 
 
 
390 aa  206  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3047  sugar transferase  51.56 
 
 
243 aa  206  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0952  general glycosylation pathway protein  50.26 
 
 
201 aa  205  2e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2523  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  49.5 
 
 
226 aa  204  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181679 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.96 
 
 
380 aa  204  3e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1255  galactosyltransferase  51.28 
 
 
200 aa  204  4e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5393  UDP-galactose phosphate transferase  51.05 
 
 
230 aa  204  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10743  putative undecaprenyl-phosphate glycosyl-1-phosphate transferase  50.77 
 
 
202 aa  203  6e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.335264  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2344  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  58.79 
 
 
232 aa  203  9e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  38.5 
 
 
381 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1381  general glycosylation pathway protein  46.67 
 
 
201 aa  196  1e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  34.7 
 
 
396 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  35.87 
 
 
387 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  33.43 
 
 
382 aa  192  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  37.26 
 
 
387 aa  189  9e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.61 
 
 
377 aa  187  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  34.3 
 
 
379 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  35.8 
 
 
388 aa  184  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  30.54 
 
 
378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  39.88 
 
 
376 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.43 
 
 
377 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  33.44 
 
 
371 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.03 
 
 
341 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  35.09 
 
 
386 aa  164  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3631  sugar transferase  43.59 
 
 
190 aa  160  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 
390 aa  160  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2852  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.65 
 
 
208 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 
362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0825804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>