More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4005 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_4005  sugar transferase  100 
 
 
206 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1698  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  61.73 
 
 
204 aa  257  9e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.965123  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2726  sugar transferase  65.13 
 
 
197 aa  255  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3256  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  59.9 
 
 
207 aa  254  7e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1934  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  66.67 
 
 
199 aa  252  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1126  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  61.62 
 
 
201 aa  250  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0875109  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3034  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  65.13 
 
 
197 aa  246  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104666  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0636  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  59.6 
 
 
207 aa  244  6e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.678977  normal  0.34007 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3389  sugar transferase  57.43 
 
 
204 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.251832  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0384  sugar transferase  59 
 
 
202 aa  240  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1664  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  60.1 
 
 
199 aa  239  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0716  sugar transferase  56.28 
 
 
207 aa  238  2.9999999999999997e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0597  general glycosylation pathway protein  59.18 
 
 
200 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1141  general glycosylation pathway protein  57.65 
 
 
200 aa  238  5e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.987369  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2648  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  61.22 
 
 
200 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679598  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1266  general glycosylation pathway protein  57.14 
 
 
200 aa  237  1e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2000  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  62.69 
 
 
215 aa  237  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5256  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  61.54 
 
 
204 aa  235  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4262  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  61.93 
 
 
206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0450  Cpp29  54.08 
 
 
201 aa  230  9e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3821  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  57.22 
 
 
206 aa  229  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0574  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  58.5 
 
 
200 aa  228  6e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.2884  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  58.16 
 
 
598 aa  226  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1255  galactosyltransferase  55.67 
 
 
200 aa  226  2e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1345  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  59.39 
 
 
206 aa  226  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.940885 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0586  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  55.1 
 
 
206 aa  225  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02342  glycosyl transferase transmembrane protein  61.22 
 
 
203 aa  223  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0378569 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2523  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  56.45 
 
 
226 aa  222  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181679 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3047  sugar transferase  54.17 
 
 
243 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2483  sugar transferase  55.38 
 
 
219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10743  putative undecaprenyl-phosphate glycosyl-1-phosphate transferase  51.02 
 
 
202 aa  218  3e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.335264  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5365  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  60 
 
 
205 aa  218  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0952  general glycosylation pathway protein  51.78 
 
 
201 aa  217  1e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1381  general glycosylation pathway protein  51.02 
 
 
201 aa  215  4e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1211  putative sugar transferase  51.53 
 
 
201 aa  214  5e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5393  UDP-galactose phosphate transferase  52.13 
 
 
230 aa  209  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30050  sugar transferase family protein  63.78 
 
 
198 aa  209  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0103418  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0038  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  59.69 
 
 
210 aa  206  2e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1529  putative YVfC-like sugar transferase  51.83 
 
 
226 aa  201  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2344  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  58.01 
 
 
232 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0494  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  52.33 
 
 
219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3644  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  51.3 
 
 
217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.212728  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5254  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  50.76 
 
 
207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0763  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  46.74 
 
 
219 aa  165  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3631  sugar transferase  44.89 
 
 
190 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2211  sugar transferase  46.63 
 
 
502 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645155  normal  0.401902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6387  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  46.35 
 
 
522 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2852  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.65 
 
 
208 aa  154  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0035  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  47.62 
 
 
487 aa  153  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.179777 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0052  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  42.11 
 
 
532 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.444086  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4579  sugar transferase  44.5 
 
 
226 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1001  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  46.49 
 
 
491 aa  151  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1519  sugar transferase  40.66 
 
 
214 aa  150  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3537  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  44.92 
 
 
488 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0569176 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1211  sugar transferase; UDP-glucose lipid carrier transferase  42.49 
 
 
199 aa  150  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.343253  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4990  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  45.21 
 
 
491 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1034  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  45.45 
 
 
490 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1586  sugar transferase  44.67 
 
 
187 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0491146  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4061  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  45.16 
 
 
522 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4131  sugar transferase  44.04 
 
 
525 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0135201  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4441  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.75 
 
 
594 aa  149  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.796924  normal  0.559619 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0462  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.27 
 
 
448 aa  149  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00445069  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08350  glycosyl transferase possibly involved in lipopolysaccharide synthesis  42.02 
 
 
201 aa  148  5e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.163172  normal  0.229141 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0481  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  42.86 
 
 
466 aa  148  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1436  sugar transferase  41.8 
 
 
329 aa  148  7e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0467092  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1331  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.71 
 
 
496 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0633  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  44.09 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.339085  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0543  hypothetical protein  46.74 
 
 
460 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1295  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  42.71 
 
 
496 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.222797  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0595  sugar transferase family protein  37.17 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.750917  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1939  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  44.04 
 
 
496 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1312  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.71 
 
 
496 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454785  normal  0.17822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1310  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  42.27 
 
 
520 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1222  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  42.78 
 
 
521 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.957103  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3206  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  44.74 
 
 
481 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2860  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  45.41 
 
 
468 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1693  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  43.55 
 
 
346 aa  145  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000262579  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2163  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  45.36 
 
 
498 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3127  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  44.02 
 
 
501 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.526829  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4755  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.92 
 
 
496 aa  145  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236094  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1337  sugar transferase  44.62 
 
 
186 aa  145  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0288404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2376  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  43.32 
 
 
461 aa  145  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3584  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  44.21 
 
 
504 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.356209  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3589  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  44.21 
 
 
504 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3657  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  44.21 
 
 
504 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0630  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  45.95 
 
 
484 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0584  glycosyltransferase  40.86 
 
 
209 aa  145  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000164965  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3542  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.21 
 
 
473 aa  144  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0786  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  47.12 
 
 
506 aa  144  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.21233  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3691  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.02 
 
 
445 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0883  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  42.19 
 
 
250 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0147  sugar transferase  38.92 
 
 
185 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4994  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.39 
 
 
470 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13272  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2949  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  42.93 
 
 
478 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2699  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.59 
 
 
477 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.438937 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0152  sugar transferase  38.92 
 
 
185 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4955  sugar transferase; phospho-glucosyltransferase  42.33 
 
 
228 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228905  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1950  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  46.41 
 
 
470 aa  143  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.756109  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2948  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  45.6 
 
 
476 aa  142  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001326  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsA sugar transferase  42.63 
 
 
466 aa  142  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>