More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0780 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  92.06 
 
 
378 aa  714    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
378 aa  758    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  92.59 
 
 
378 aa  707    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  92.06 
 
 
378 aa  701    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  91.8 
 
 
378 aa  702    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  98.41 
 
 
378 aa  748    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  91.8 
 
 
378 aa  702    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  79.1 
 
 
378 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  79.1 
 
 
378 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  79.37 
 
 
378 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  79.1 
 
 
385 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  79.1 
 
 
385 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  79.1 
 
 
385 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  79.1 
 
 
385 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  79.1 
 
 
385 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  71.76 
 
 
390 aa  551  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  70.9 
 
 
382 aa  548  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  70.9 
 
 
382 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  44.38 
 
 
381 aa  285  7e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  43.54 
 
 
379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  42.7 
 
 
404 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  44.05 
 
 
373 aa  262  6e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  43.01 
 
 
408 aa  262  6.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  33.6 
 
 
378 aa  250  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  41.87 
 
 
382 aa  248  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  42.47 
 
 
374 aa  246  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 
369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  38.56 
 
 
377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.56 
 
 
380 aa  240  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  41.73 
 
 
384 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  42.19 
 
 
372 aa  232  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  38.95 
 
 
371 aa  230  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  38.19 
 
 
371 aa  229  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  42.27 
 
 
598 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  39.78 
 
 
381 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  38.74 
 
 
381 aa  226  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  38.29 
 
 
373 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  37.23 
 
 
396 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 
362 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  34.99 
 
 
379 aa  219  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  40.5 
 
 
387 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  37.57 
 
 
382 aa  210  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  32.7 
 
 
374 aa  210  4e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  36.78 
 
 
387 aa  209  7e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  38.87 
 
 
376 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 
383 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.27 
 
 
341 aa  203  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 
375 aa  200  3e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.32 
 
 
377 aa  197  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  35.66 
 
 
388 aa  195  9e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  34.26 
 
 
390 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  36.46 
 
 
386 aa  189  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 
381 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.91 
 
 
377 aa  186  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 
382 aa  182  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 
371 aa  182  8.000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  34.31 
 
 
379 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  30.16 
 
 
371 aa  160  3e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  27.06 
 
 
375 aa  160  5e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  27.78 
 
 
376 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 
385 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  33.42 
 
 
371 aa  157  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  28.04 
 
 
376 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  27.51 
 
 
376 aa  156  7e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  30.79 
 
 
371 aa  155  8e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  31.35 
 
 
396 aa  152  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 
399 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  38.36 
 
 
374 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  43.23 
 
 
339 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  27.1 
 
 
370 aa  142  8e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
390 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
375 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.72 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  25.53 
 
 
377 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  25.53 
 
 
377 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  25.15 
 
 
383 aa  117  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
387 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
387 aa  103  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 
389 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
362 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
382 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2649  glycosyl transferase, group 1  23.23 
 
 
381 aa  99  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.41535  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
408 aa  96.3  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  23.24 
 
 
384 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
386 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  29.4 
 
 
379 aa  92.8  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5046  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 
379 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1349  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
394 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  24.45 
 
 
379 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
414 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 
413 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
387 aa  86.7  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5353  glycosyl transferase group 1  33.23 
 
 
379 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>