More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1919 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1919  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 407 aa  827    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854337 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 390 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0487  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 		 394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000304875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 		 394 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 		 388 aa  127  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 		 388 aa  127  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 		 401 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 377 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  30.25 
 
 		 391 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 		 371 aa  119  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  25.99 
 
 		 369 aa  119  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 378 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 		 379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 		 379 aa  114  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 		 367 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  29.97 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 367 aa  111  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 371 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  27.55 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.63 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  24.85 
 
 		 383 aa  106  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4401  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.32 
 
 		 365 aa  102  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2188  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.891642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5390  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 		 371 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.53 
 
 		 366 aa  99.8  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 		 385 aa  99.8  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 		 388 aa  99.8  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 		 403 aa  99.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4413  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 		 394 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 		 369 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1210  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 		 373 aa  97.8  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 		 412 aa  97.4  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4101  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 		 393 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 		 376 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 393 aa  96.3  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 		 389 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  22.64 
 
 		 367 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  28.21 
 
 		 388 aa  94.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00458  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.6 
 
 		 363 aa  94.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0297  glycosyl transferase, group 1  25.95 
 
 		 371 aa  94.4  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 		 387 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3269  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 374 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.67 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 		 363 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 403 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 		 373 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1045  group 1 glycosyl transferase  26.59 
 
 		 353 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000151909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 		 380 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 		 439 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  26.2 
 
 		 745 aa  91.3  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2649  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 381 aa  90.9  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.41535  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 		 374 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 		 387 aa  90.1  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 377 aa  89.7  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0320  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  24 
 
 		 374 aa  88.6  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 		 384 aa  89  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 393 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 383 aa  87.4  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  33.57 
 
 		 750 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.49 
 
 		 380 aa  86.7  8e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  27.49 
 
 		 377 aa  86.3  9e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.69 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 		 401 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 		 409 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  23.74 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  24.53 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>