More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5554 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2477  glycosyl transferase, group 1 family protein  83.76 
 
 		 394 aa  646    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  84.01 
 
 		 394 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  96.45 
 
 		 394 aa  778    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4911  glycosyl transferase group 1  92.39 
 
 		 394 aa  719    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527182  hitchhiker  0.000729533 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  96.69 
 
 		 394 aa  779    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2615  glycosyl transferase, group 1 family protein  83.76 
 
 		 394 aa  646    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 394 aa  808    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  96.69 
 
 		 394 aa  779    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  96.69 
 
 		 394 aa  779    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  98.98 
 
 		 394 aa  800    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0551  glycosyltransferase  82.49 
 
 		 394 aa  632  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.268857  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  78.61 
 
 		 411 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  76.2 
 
 		 409 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  75.4 
 
 		 409 aa  579  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  55.23 
 
 		 392 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  52.03 
 
 		 390 aa  358  6e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  43.19 
 
 		 400 aa  328  1.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  42.11 
 
 		 378 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  45.95 
 
 		 381 aa  302  8.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  41.18 
 
 		 386 aa  266  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  38.65 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.01 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 		 377 aa  99.8  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 		 401 aa  97.1  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 		 398 aa  97.1  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.43 
 
 		 419 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0230  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 		 369 aa  95.9  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  33.62 
 
 		 405 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  32.85 
 
 		 386 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 382 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  31.42 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0592  glycosyltransferase-like protein  29.54 
 
 		 379 aa  94  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  29.6 
 
 		 369 aa  93.6  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  30.55 
 
 		 406 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0291  glycosyl transferase group 1  31.92 
 
 		 376 aa  93.6  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  36.28 
 
 		 388 aa  93.6  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 		 439 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 		 439 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.43 
 
 		 378 aa  92.8  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  30.87 
 
 		 370 aa  92  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6086  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 		 434 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964104  decreased coverage  0.00104043 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 		 407 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 		 419 aa  92  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 357 aa  92  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 		 346 aa  92  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.06 
 
 		 366 aa  90.9  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 		 394 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 		 391 aa  90.5  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 		 378 aa  90.1  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 		 386 aa  89.7  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  37.2 
 
 		 376 aa  89.7  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 363 aa  89.4  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 369 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  34.98 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  30.33 
 
 		 430 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.33 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 438 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 		 384 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 		 438 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  36.28 
 
 		 421 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 		 394 aa  88.2  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  23.47 
 
 		 411 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 		 377 aa  87.4  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 		 394 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 		 394 aa  87  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2085  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 		 401 aa  87  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 		 378 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  34.58 
 
 		 384 aa  86.7  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  24.18 
 
 		 411 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1737  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 403 aa  86.3  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  27.16 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1997  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.336344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2628  glycosyl transferase group 1  37.64 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00259804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3923  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>