More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2085 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2085  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 401 aa  826    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1977  glycosyl transferase, group 1  63.2 
 
 		 404 aa  488  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.665081 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1737  glycosyl transferase, group 1  59.5 
 
 		 403 aa  482  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 		 386 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 372 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2597  putative glycosyltransferase  28.78 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 		 369 aa  96.7  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 		 372 aa  96.3  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 		 411 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 		 409 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  37.3 
 
 		 386 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0230  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 369 aa  90.5  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 		 375 aa  90.1  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 		 409 aa  89.7  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  31.67 
 
 		 400 aa  89.7  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 		 394 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 		 394 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0291  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4376  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1409  WabG  23.08 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  27.86 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1274  glucosyltransferase I  27.18 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 		 810 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6086  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964104  decreased coverage  0.00104043 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0074  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  27.63 
 
 		 425 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  24.12 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  26.84 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  35.11 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  34.18 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.51 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0164155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4056  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.51 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44840  Lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.78 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3840  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.51 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000503275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4132  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  27.92 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000485252  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1098  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.152067 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3966  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.51 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  24.21 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  30.27 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1997  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.723795  normal  0.0390531 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  25.48 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  28.18 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0080  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.439798  hitchhiker  0.0000576629 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0319  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.661242  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03488  glucosyltransferase I  28.1 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03440  hypothetical protein  28.1 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 		 378 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  27.64 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  22.89 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  27.14 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.4 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  37.28 
 
 		 803 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0522  glycosyl transferase, group 1  24.89 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.62557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  31.75 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0592  glycosyltransferase-like protein  30.81 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 		 458 aa  73.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.77 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  27.39 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3939  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  27.39 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4047  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  25.49 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.40753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4109  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  26.67 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0581  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0475822 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  26.17 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 		 386 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 		 536 aa  72.8  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3921  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  26.67 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.149392  hitchhiker  0.00193824 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0368  glycosyl transferase, group 1  24.04 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0343  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  23.69 
 
 		 374 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.213865  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.81 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>