More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4376 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4376  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 371 aa  769    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0074  glycosyl transferase group 1  59.78 
 
 		 374 aa  478  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3921  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  60.33 
 
 		 374 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.149392  hitchhiker  0.00193824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3939  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  60.33 
 
 		 374 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4109  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  60.33 
 
 		 374 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  60.33 
 
 		 374 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3966  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  59.51 
 
 		 374 aa  472  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4047  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  60.05 
 
 		 374 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.40753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4132  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  59.24 
 
 		 374 aa  471  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000485252  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03488  glucosyltransferase I  58.97 
 
 		 374 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  58.97 
 
 		 374 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0164155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4056  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  58.97 
 
 		 374 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03440  hypothetical protein  58.97 
 
 		 374 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3840  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  59.24 
 
 		 374 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000503275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0080  glycosyl transferase group 1  59.24 
 
 		 374 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.439798  hitchhiker  0.0000576629 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0368  glycosyl transferase, group 1  51.49 
 
 		 374 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0343  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  51.22 
 
 		 374 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.213865  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5745  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  51.22 
 
 		 373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0371  glycosyl transferase group 1  51.22 
 
 		 374 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145576  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66230  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  50.95 
 
 		 373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4860  glycosyl transferase group 1  50.68 
 
 		 374 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.480448 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0522  glycosyl transferase, group 1  50.68 
 
 		 373 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.62557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0581  glycosyl transferase, group 1  50.14 
 
 		 374 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0475822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  49.59 
 
 		 373 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0467  glycosyl transferase, group 1  49.05 
 
 		 373 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44840  Lipopolysaccharide core biosynthesis protein  49.86 
 
 		 374 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0319  glycosyl transferase group 1  44.86 
 
 		 378 aa  325  7e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.661242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2793  glycosyl transferase, group 1  44.05 
 
 		 377 aa  312  4.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.09685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0754  glycosyl transferase, group 1  37.81 
 
 		 391 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.100141 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1274  glucosyltransferase I  35.92 
 
 		 364 aa  242  7e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2805  glycosyl transferase group 1  34.22 
 
 		 372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2925  glycosyl transferase, group 1  33.88 
 
 		 373 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2544  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 		 371 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1342  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 		 366 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4237  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 		 361 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.905319 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4088  glycosyl transferase, group 1  32.49 
 
 		 369 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 		 381 aa  100  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 		 372 aa  99.4  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 		 386 aa  97.4  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 		 400 aa  93.6  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1737  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2597  putative glycosyltransferase  26.43 
 
 		 374 aa  90.1  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  25.89 
 
 		 391 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.14 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1098  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.152067 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2085  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  23.32 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1977  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.665081 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  27.19 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  21.3 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  24.85 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0551  glycosyltransferase  29.95 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.268857  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0592  glycosyltransferase-like protein  30.83 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 396 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4915  hypothetical protein  29.52 
 
 		 182 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.327888  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  34.39 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0615  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2615  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.16 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  22.22 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  28.16 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2477  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.16 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  28.06 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.06 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.89 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4911  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527182  hitchhiker  0.000729533 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0291  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  26.99 
 
 		 458 aa  69.7  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0230  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 		 369 aa  69.3  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 385 aa  69.3  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  23.38 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1045  group 1 glycosyl transferase  25.6 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000151909  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  24.17 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  25.12 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 		 355 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 		 383 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  24.03 
 
 		 371 aa  67  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 		 402 aa  67  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>