More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2805 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2805  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 372 aa  743    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2544  glycosyl transferase, group 1  57.14 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2925  glycosyl transferase, group 1  55.65 
 
 		 373 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3939  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  37.23 
 
 		 374 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3921  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  36.87 
 
 		 374 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.149392  hitchhiker  0.00193824 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  36.87 
 
 		 374 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4109  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  36.87 
 
 		 374 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4047  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  36.6 
 
 		 374 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.40753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3966  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  37.6 
 
 		 374 aa  243  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237842  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0074  glycosyl transferase group 1  37.23 
 
 		 374 aa  243  5e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0080  glycosyl transferase group 1  37.27 
 
 		 374 aa  243  5e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.439798  hitchhiker  0.0000576629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03488  glucosyltransferase I  37.27 
 
 		 374 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03440  hypothetical protein  37.27 
 
 		 374 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3840  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  36.73 
 
 		 374 aa  242  9e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000503275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4132  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  36.8 
 
 		 374 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000485252  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4056  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  37.33 
 
 		 374 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  37.27 
 
 		 374 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0164155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66230  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  40.26 
 
 		 373 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5745  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  40.05 
 
 		 373 aa  236  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0467  glycosyl transferase, group 1  39.58 
 
 		 373 aa  236  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0371  glycosyl transferase group 1  39.89 
 
 		 374 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145576  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0343  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  40.16 
 
 		 374 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.213865  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0368  glycosyl transferase, group 1  40.16 
 
 		 374 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4860  glycosyl transferase group 1  38.79 
 
 		 374 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.480448 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44840  Lipopolysaccharide core biosynthesis protein  39.79 
 
 		 374 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0581  glycosyl transferase, group 1  39.52 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0475822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0522  glycosyl transferase, group 1  38.73 
 
 		 373 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.62557  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  38.73 
 
 		 373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4376  glycosyl transferase group 1  34.22 
 
 		 371 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0754  glycosyl transferase, group 1  33.95 
 
 		 391 aa  193  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.100141 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0319  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.661242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2793  glycosyl transferase, group 1  34.38 
 
 		 377 aa  183  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.09685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4237  glycosyl transferase, group 1  38.12 
 
 		 361 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.905319 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4088  glycosyl transferase, group 1  35.65 
 
 		 369 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1274  glucosyltransferase I  32.29 
 
 		 364 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1342  glycosyl transferase, group 1  34.13 
 
 		 366 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 		 381 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 		 372 aa  89.7  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4915  hypothetical protein  34.3 
 
 		 182 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.327888  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  35.43 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  36.94 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  35.96 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  25.3 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5864  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.09 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  32.52 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1098  glycosyl transferase group 1  40.74 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.152067 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 		 930 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0291  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  36.6 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1737  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0812  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol  31.03 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  30.92 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  22.98 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5208  glycosyl transferase group 1  36.52 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  normal  0.673241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3289  putative LPS biosynthesis-related protein  27.05 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0723  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  36.44 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0551  glycosyltransferase  26.73 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.268857  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  37.91 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  36 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 		 371 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4911  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527182  hitchhiker  0.000729533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2100  glycosyl transferase, group 1  25.43 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1082  putative glycosyltransferase  27.61 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1402  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.06 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1635  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 		 623 aa  60.5  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030735  normal  0.881168 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  21.87 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  23.49 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2615  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.75 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0967  hypothetical protein  30.66 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3474  glycosyl transferases group 1 protein  25 
 
 		 422 aa  59.7  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.649202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 		 365 aa  59.3  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0615  glycosyl transferase, group 1  23.74 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  28.88 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  26.55 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2477  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.75 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>