More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0967 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0967  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  674    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1077  glycosyl transferase, group 1  47.99 
 
 
325 aa  317  2e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.508973  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0120  glycosyl transferase, group 1  44.44 
 
 
325 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0941  glycosyl transferase group 1  45.51 
 
 
325 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.018842  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1727  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 
389 aa  152  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00570551  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0960  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
345 aa  143  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0738  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0388  glycosyltransferase  30.69 
 
 
335 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3633  glycosyl transferase group 1  34.32 
 
 
339 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1322  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
342 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580469  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0610  glycosyl transferase, family 1  30.48 
 
 
334 aa  117  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0649  glycosyltransferase  29.89 
 
 
343 aa  106  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.109124  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1228  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
330 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000548043 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0778  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
333 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0355299  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0709  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.09 
 
 
332 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1588  glycosyltransferase  27.12 
 
 
347 aa  100  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3517  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
329 aa  99.4  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2440  glycosyltransferase  27.92 
 
 
332 aa  99  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2810  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
356 aa  98.6  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12200  glycosyltransferase  26.3 
 
 
376 aa  94  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0160  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
337 aa  92  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1997  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
359 aa  91.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.723795  normal  0.0390531 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
394 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
810 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3516  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
367 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
384 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 
389 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1234  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000428229 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1082  putative glycosyltransferase  23.34 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  23.7 
 
 
769 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  25.78 
 
 
395 aa  72.8  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  26.12 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
378 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.85 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12220  glycosyltransferase  24.66 
 
 
432 aa  69.3  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.296579  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
384 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  24.17 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1972  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0575164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  24.83 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1232  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.35 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
446 aa  67  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  25.31 
 
 
376 aa  67  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4687  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 
390 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03488  glucosyltransferase I  28.87 
 
 
374 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3966  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.87 
 
 
374 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237842  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.87 
 
 
374 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0164155  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03440  hypothetical protein  28.87 
 
 
374 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4132  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.87 
 
 
374 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000485252  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
377 aa  64.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
385 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
819 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 
390 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6086  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 
434 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964104  decreased coverage  0.00104043 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3840  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.87 
 
 
374 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000503275  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  28.02 
 
 
350 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4056  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.87 
 
 
374 aa  65.1  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  24.27 
 
 
376 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
373 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 
390 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 
409 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 
386 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
402 aa  64.3  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
377 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
379 aa  63.9  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 
375 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0080  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
374 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.439798  hitchhiker  0.0000576629 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  24.9 
 
 
376 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  23.3 
 
 
360 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
380 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  22.09 
 
 
382 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  22.6 
 
 
394 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  27.51 
 
 
374 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  22.09 
 
 
382 aa  63.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  22.49 
 
 
436 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4109  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  27.51 
 
 
374 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  25.49 
 
 
377 aa  62.8  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
399 aa  63.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
385 aa  63.2  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1218  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 
364 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
385 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 
387 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0074  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
374 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
453 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
396 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3939  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  26.98 
 
 
374 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0291  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
376 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 
384 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  28.09 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 
384 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
374 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  22.82 
 
 
402 aa  62  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
356 aa  62  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
413 aa  61.6  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  24.31 
 
 
367 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>