More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4002 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03488  glucosyltransferase I  89.04 
 
 		 374 aa  703    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0074  glycosyl transferase group 1  86.36 
 
 		 374 aa  684    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3840  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  88.24 
 
 		 374 aa  696    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000503275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3966  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  89.3 
 
 		 374 aa  704    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3921  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  99.47 
 
 		 374 aa  778    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.149392  hitchhiker  0.00193824 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  89.04 
 
 		 374 aa  702    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0164155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4056  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  88.77 
 
 		 374 aa  698    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4109  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  99.73 
 
 		 374 aa  779    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0080  glycosyl transferase group 1  89.04 
 
 		 374 aa  703    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.439798  hitchhiker  0.0000576629 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03440  hypothetical protein  89.04 
 
 		 374 aa  703    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  100 
 
 		 374 aa  782    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4047  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  99.47 
 
 		 374 aa  778    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.40753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3939  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  99.47 
 
 		 374 aa  779    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4132  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  89.3 
 
 		 374 aa  706    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000485252  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4376  glycosyl transferase group 1  60.33 
 
 		 371 aa  476  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0522  glycosyl transferase, group 1  52.02 
 
 		 373 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.62557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4860  glycosyl transferase group 1  51.89 
 
 		 374 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.480448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5745  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  52.02 
 
 		 373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66230  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  51.75 
 
 		 373 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0368  glycosyl transferase, group 1  52.16 
 
 		 374 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0343  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  51.62 
 
 		 374 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.213865  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  51.48 
 
 		 373 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0371  glycosyl transferase group 1  52.16 
 
 		 374 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145576  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0581  glycosyl transferase, group 1  50.67 
 
 		 374 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0475822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0467  glycosyl transferase, group 1  50.4 
 
 		 373 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44840  Lipopolysaccharide core biosynthesis protein  51.09 
 
 		 374 aa  391  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0319  glycosyl transferase group 1  45.97 
 
 		 378 aa  333  4e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.661242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2793  glycosyl transferase, group 1  46.79 
 
 		 377 aa  326  3e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.09685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0754  glycosyl transferase, group 1  38.57 
 
 		 391 aa  266  4e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.100141 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1274  glucosyltransferase I  38.97 
 
 		 364 aa  255  7e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2805  glycosyl transferase group 1  36.87 
 
 		 372 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2544  glycosyl transferase, group 1  35.23 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2925  glycosyl transferase, group 1  36.22 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1342  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 		 366 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4088  glycosyl transferase, group 1  33.24 
 
 		 369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4237  glycosyl transferase, group 1  33.8 
 
 		 361 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.905319 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 		 386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 		 375 aa  96.3  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2597  putative glycosyltransferase  28.53 
 
 		 374 aa  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 		 381 aa  90.9  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  27.13 
 
 		 442 aa  89  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1098  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.152067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1977  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.665081 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  24.93 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6086  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964104  decreased coverage  0.00104043 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.83 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 438 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  30.22 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4915  hypothetical protein  28.31 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.327888  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  23.32 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  30.22 
 
 		 417 aa  72  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1737  glycosyl transferase, group 1  22.53 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0230  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2085  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0291  glycosyl transferase group 1  23.33 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  24.63 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1412  putative glycosyl transferases group 1  23.33 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  26.62 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  26.13 
 
 		 650 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0615  glycosyl transferase, group 1  22.42 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 		 672 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 		 411 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.67 
 
 		 382 aa  67  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 		 382 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  27.56 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  32.5 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1454  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0515255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  24.48 
 
 		 364 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.5 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  31.94 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1022  hypothetical protein  28.09 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>