More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0615 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0615  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
377 aa  770    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0291  glycosyl transferase group 1  52.88 
 
 
376 aa  360  2e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0230  glycosyl transferase group 1  48.7 
 
 
369 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1098  glycosyl transferase group 1  33.08 
 
 
408 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.152067 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0592  glycosyltransferase-like protein  33.43 
 
 
379 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
375 aa  103  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 
381 aa  103  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 
400 aa  99.4  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  28.13 
 
 
369 aa  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  33.48 
 
 
409 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6086  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
434 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964104  decreased coverage  0.00104043 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 
409 aa  89.7  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
372 aa  88.6  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2597  putative glycosyltransferase  28.53 
 
 
374 aa  86.7  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
394 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
394 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
394 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
381 aa  86.3  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1236  WabG  26.89 
 
 
343 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  37.01 
 
 
394 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  38.81 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 
411 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  36.22 
 
 
394 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
394 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  36.17 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0478  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.63 
 
 
343 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  32.65 
 
 
362 aa  78.2  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.58 
 
 
390 aa  77  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  31.79 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0551  glycosyltransferase  36.3 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.268857  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  31.58 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
370 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  34.09 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4376  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
371 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0522  glycosyl transferase, group 1  25.21 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.62557  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2085  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 
401 aa  72.4  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2615  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.25 
 
 
394 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
394 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1409  WabG  22.32 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1737  glycosyl transferase, group 1  24.34 
 
 
403 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  31.74 
 
 
386 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  34.25 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2477  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.25 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  27.41 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2925  glycosyl transferase, group 1  25.7 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
388 aa  71.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4911  glycosyl transferase group 1  37.11 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527182  hitchhiker  0.000729533 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0467  glycosyl transferase, group 1  23.6 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1274  glucosyltransferase I  24.02 
 
 
364 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0371  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145576  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0343  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  24.36 
 
 
374 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.213865  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  23.82 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0368  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 
374 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0080  glycosyl transferase group 1  22.8 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.439798  hitchhiker  0.0000576629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4132  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  22.49 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000485252  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0754  glycosyl transferase, group 1  23.58 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.100141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  27.86 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  22.49 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0164155  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03488  glucosyltransferase I  22.49 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03440  hypothetical protein  22.49 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  26 
 
 
383 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  31.21 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  26.98 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  22.42 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4056  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  22.49 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3840  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  22.49 
 
 
374 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000503275  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  26.07 
 
 
340 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  23.16 
 
 
400 aa  67  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3939  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  22.42 
 
 
374 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 
389 aa  66.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1412  putative glycosyl transferases group 1  26.12 
 
 
389 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
370 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0587  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.862017 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3966  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  22.19 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237842  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
401 aa  66.2  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3289  putative LPS biosynthesis-related protein  24.87 
 
 
358 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502045  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
440 aa  66.2  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
377 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2684  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
328 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.94042 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 
351 aa  66.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3921  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  22.12 
 
 
374 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.149392  hitchhiker  0.00193824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4047  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  22.12 
 
 
374 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.40753  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44790  Glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 
386 aa  66.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4109  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  22.12 
 
 
374 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4991  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.76 
 
 
376 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 
403 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44840  Lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.37 
 
 
374 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>