More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_44840 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0581  glycosyl transferase, group 1  81.82 
 
 		 374 aa  634    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0475822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5745  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  83.29 
 
 		 373 aa  635    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44840  Lipopolysaccharide core biosynthesis protein  100 
 
 		 374 aa  759    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66230  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  83.83 
 
 		 373 aa  638    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  78.23 
 
 		 373 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0522  glycosyl transferase, group 1  77.42 
 
 		 373 aa  607  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.62557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4860  glycosyl transferase group 1  78.61 
 
 		 374 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.480448 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0371  glycosyl transferase group 1  78.07 
 
 		 374 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145576  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0343  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  77.81 
 
 		 374 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.213865  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0368  glycosyl transferase, group 1  77.54 
 
 		 374 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0467  glycosyl transferase, group 1  76.41 
 
 		 373 aa  595  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03488  glucosyltransferase I  51.36 
 
 		 374 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0080  glycosyl transferase group 1  51.63 
 
 		 374 aa  396  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.439798  hitchhiker  0.0000576629 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03440  hypothetical protein  51.36 
 
 		 374 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3966  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  51.63 
 
 		 374 aa  395  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237842  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0074  glycosyl transferase group 1  50.82 
 
 		 374 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4132  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  51.09 
 
 		 374 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000485252  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  51.09 
 
 		 374 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  51.09 
 
 		 374 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0164155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4056  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  51.09 
 
 		 374 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3939  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  51.09 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3840  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  51.09 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000503275  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3921  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  51.09 
 
 		 374 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.149392  hitchhiker  0.00193824 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4109  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  51.09 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4047  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  50.82 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.40753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4376  glycosyl transferase group 1  49.86 
 
 		 371 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2793  glycosyl transferase, group 1  48.38 
 
 		 377 aa  345  8.999999999999999e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.09685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0319  glycosyl transferase group 1  47.84 
 
 		 378 aa  342  7e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.661242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0754  glycosyl transferase, group 1  43.53 
 
 		 391 aa  310  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.100141 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1274  glucosyltransferase I  39.26 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2805  glycosyl transferase group 1  39.79 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2544  glycosyl transferase, group 1  38.44 
 
 		 371 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2925  glycosyl transferase, group 1  38.93 
 
 		 373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1342  glycosyl transferase, group 1  35.92 
 
 		 366 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4088  glycosyl transferase, group 1  33.24 
 
 		 369 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4237  glycosyl transferase, group 1  33.23 
 
 		 361 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.905319 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 		 372 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 		 372 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 		 381 aa  106  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 		 386 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 		 375 aa  103  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2597  putative glycosyltransferase  26.28 
 
 		 374 aa  93.6  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 402 aa  91.3  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 		 381 aa  90.1  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1098  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.152067 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  30.12 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.12 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  23.26 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 		 394 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 		 394 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 		 394 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1737  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.72 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0812  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol  27.78 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  25.6 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0592  glycosyltransferase-like protein  26.27 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1454  glycosyl transferase group 1  22.59 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0515255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2085  glycosyl transferase, group 1  26.78 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.5 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  27.78 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0779  glycosyl transferase, group 1  25.42 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0723  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 		 386 aa  67  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 385 aa  67  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.61 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1977  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.665081 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 387 aa  67  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  24.05 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6086  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964104  decreased coverage  0.00104043 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0356  glycosyl transferase, group 1  27.19 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  23.87 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.17 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4075  glycosyl transferase, group 1  30.47 
 
 		 744 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  33.14 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0615  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.91 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>