More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3289 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3289  putative LPS biosynthesis-related protein  100 
 
 
358 aa  720    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502045  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1256  glycosyl transferase group 1  86.87 
 
 
358 aa  616  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121425  normal  0.610922 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1911  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  68.86 
 
 
360 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.365858  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0329  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  68.86 
 
 
360 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1358  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  68.86 
 
 
379 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1046  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  68.86 
 
 
360 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0822  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  68.86 
 
 
360 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1199  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  68.86 
 
 
360 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1208  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  68.86 
 
 
360 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0986  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  69.94 
 
 
363 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3923  glycosyl transferase group 1  67.34 
 
 
356 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2402  glycosyl transferase group 1  49.28 
 
 
355 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.923464  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2007  glycosyl transferase group 1  49 
 
 
355 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.909403  normal  0.304999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
375 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 
409 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
381 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  28.15 
 
 
424 aa  87.4  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  27.21 
 
 
381 aa  86.7  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.84 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 
400 aa  85.5  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0230  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  30.04 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  27.11 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
372 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
448 aa  77  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  32.51 
 
 
394 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  32.51 
 
 
394 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  32.51 
 
 
394 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4911  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527182  hitchhiker  0.000729533 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0551  glycosyltransferase  25.38 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.268857  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0291  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  27.94 
 
 
417 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 
372 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
372 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
384 aa  73.6  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  27.02 
 
 
394 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  28.49 
 
 
466 aa  73.2  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2615  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.77 
 
 
394 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  24.77 
 
 
394 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2477  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.77 
 
 
394 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2925  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
373 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
426 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
435 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  28.88 
 
 
417 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0615  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.1 
 
 
435 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2805  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1322  glycosyl transferase, group 1  34.23 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580469  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  28.03 
 
 
420 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
440 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  31.43 
 
 
443 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  28.96 
 
 
431 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  28.88 
 
 
450 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0779  glycosyl transferase, group 1  22.33 
 
 
368 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1454  glycosyl transferase group 1  22.96 
 
 
374 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0515255  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  30.19 
 
 
393 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  33.15 
 
 
427 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2544  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
371 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  26.97 
 
 
428 aa  63.9  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  31.22 
 
 
400 aa  63.2  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0478  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.41 
 
 
343 aa  63.5  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
404 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
425 aa  63.2  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1737  glycosyl transferase, group 1  24.7 
 
 
403 aa  62.8  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  23.17 
 
 
426 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.07 
 
 
423 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1311  glycosyl transferase group 1  23.05 
 
 
426 aa  62  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  25.77 
 
 
404 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2597  putative glycosyltransferase  25.25 
 
 
374 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 
395 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.74 
 
 
388 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
422 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  30.77 
 
 
413 aa  60.8  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  26.61 
 
 
418 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1409  WabG  24.26 
 
 
343 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
385 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
398 aa  60.5  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  23.16 
 
 
422 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.91 
 
 
382 aa  60.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4336  UDP-N-acetylglucosamine  27.86 
 
 
429 aa  60.1  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
405 aa  60.5  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0042  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
366 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0592  glycosyltransferase-like protein  31.34 
 
 
379 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2085  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 
401 aa  60.1  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
417 aa  60.1  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  29.1 
 
 
438 aa  60.1  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 
397 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  23.8 
 
 
386 aa  59.3  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
377 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
398 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>