More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5739 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  100 
 
 		 378 aa  756    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  97.09 
 
 		 378 aa  741    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  74.32 
 
 		 376 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  73.99 
 
 		 376 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  72.87 
 
 		 376 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  72.61 
 
 		 376 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  71.81 
 
 		 376 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  71.66 
 
 		 376 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4991  glycosyl transferase, group 1 family protein  70.86 
 
 		 376 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44790  Glycosyl transferase, group 1  71.74 
 
 		 386 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0587  glycosyl transferase, group 1  67.32 
 
 		 372 aa  471  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.862017 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0763  glycosyl transferase, group 1  56.23 
 
 		 364 aa  401  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0477  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 		 384 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  33.89 
 
 		 381 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  31.29 
 
 		 385 aa  119  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0589  glycosyl transferase, group 1  32.81 
 
 		 381 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2798  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 378 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  36.23 
 
 		 385 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  30.24 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  33.58 
 
 		 415 aa  99.8  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  36.2 
 
 		 384 aa  98.2  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 		 370 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  28.01 
 
 		 362 aa  97.1  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 365 aa  97.4  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 389 aa  97.1  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  33.59 
 
 		 387 aa  96.3  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 		 424 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  38.94 
 
 		 377 aa  95.9  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 		 438 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 		 384 aa  94.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 		 439 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 		 438 aa  92.8  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  32.18 
 
 		 439 aa  92.8  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  32.18 
 
 		 439 aa  92.8  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  32.53 
 
 		 438 aa  92.8  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 		 391 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.46 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  37.11 
 
 		 419 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 386 aa  91.3  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 		 391 aa  90.9  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 		 398 aa  90.5  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 		 377 aa  90.9  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.82 
 
 		 371 aa  90.1  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  34.16 
 
 		 385 aa  90.1  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 536 aa  90.1  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  37.8 
 
 		 399 aa  90.1  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 		 440 aa  90.1  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  30.72 
 
 		 468 aa  89.4  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  36.92 
 
 		 399 aa  89.4  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4938  glycosyl transferase, putative  32.88 
 
 		 379 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  28.2 
 
 		 425 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  36.08 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.2 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 		 371 aa  87.8  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  35.64 
 
 		 390 aa  87  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 		 373 aa  87  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  29.69 
 
 		 350 aa  86.7  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 362 aa  86.3  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.48 
 
 		 365 aa  86.3  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 		 415 aa  86.3  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 		 381 aa  86.3  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  28.12 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4810  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 		 363 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  35.37 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  34.24 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2139  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  38.82 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  33.02 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  29.51 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  28.57 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6091  glycosyl transferase group 1  35 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  decreased coverage  0.00114888 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  32.83 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  38.6 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  34.81 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  29.31 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  40.74 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  32.53 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 		 669 aa  83.2  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>