More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02220 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  760    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  67.05 
 
 
372 aa  488  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  48.59 
 
 
362 aa  330  2e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
385 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 
399 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
389 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
379 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
373 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
401 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 
403 aa  123  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.06 
 
 
359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 
394 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  28.46 
 
 
388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  32.83 
 
 
370 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
390 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
377 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
398 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.45 
 
 
367 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  28.09 
 
 
371 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 
439 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
385 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
370 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
377 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
371 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  36.98 
 
 
376 aa  106  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
398 aa  106  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  35.91 
 
 
344 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
381 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
395 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  37.43 
 
 
344 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
374 aa  105  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
382 aa  103  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  33.66 
 
 
390 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
374 aa  103  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 
345 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  36.87 
 
 
344 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 
372 aa  103  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 
368 aa  103  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0230  glycosyl transferase group 1  35.08 
 
 
369 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  30.24 
 
 
378 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.07 
 
 
366 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  31.25 
 
 
480 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
389 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  27.37 
 
 
411 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
369 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
379 aa  100  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  30.24 
 
 
378 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  37.14 
 
 
360 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
391 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
399 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 
373 aa  99.8  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
371 aa  99.8  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 
391 aa  99.4  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.65 
 
 
365 aa  99.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3398  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 
382 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
376 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
386 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  35.61 
 
 
426 aa  98.2  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3401  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
369 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 
373 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4421  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
370 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  27.38 
 
 
402 aa  98.2  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 
360 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
439 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  34.72 
 
 
386 aa  97.4  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  26.18 
 
 
384 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  35.52 
 
 
348 aa  97.8  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
377 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  32.38 
 
 
357 aa  96.7  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
394 aa  96.7  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  37.06 
 
 
750 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0914  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.8 
 
 
375 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000157523  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 
450 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44790  Glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 
386 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
395 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0759  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
364 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
394 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  35.11 
 
 
388 aa  95.1  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
394 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
394 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 
387 aa  94  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  33.73 
 
 
350 aa  94  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 
390 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  38.32 
 
 
389 aa  94.4  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
374 aa  93.6  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  31.33 
 
 
401 aa  94  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.2 
 
 
390 aa  94  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  37.32 
 
 
739 aa  93.6  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  33.33 
 
 
402 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
374 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
372 aa  93.2  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  32.91 
 
 
350 aa  93.2  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
421 aa  92.8  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>