More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4999 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
367 aa  753    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.51 
 
 
359 aa  133  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
377 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 
383 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
379 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
371 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 
401 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
383 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  27.45 
 
 
370 aa  109  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 
385 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
386 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  23.01 
 
 
371 aa  107  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
382 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 
380 aa  106  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
374 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 
355 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 
376 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
371 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 
399 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02226  hypothetical protein  31.75 
 
 
394 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
401 aa  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.56 
 
 
419 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 
361 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
374 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
364 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  31.58 
 
 
426 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
374 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
381 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 
389 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
365 aa  100  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  26.18 
 
 
745 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
376 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
395 aa  99.8  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 
364 aa  99.8  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
369 aa  99.4  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  25.94 
 
 
372 aa  99.4  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 
372 aa  99.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.3 
 
 
366 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  30.69 
 
 
401 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
381 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
672 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 
393 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
369 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 
748 aa  97.4  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
453 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.42 
 
 
381 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
374 aa  97.1  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
384 aa  97.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
376 aa  96.7  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.68 
 
 
388 aa  96.7  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  32.2 
 
 
383 aa  96.7  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 
358 aa  96.7  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 
387 aa  96.3  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 
364 aa  96.3  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
374 aa  96.3  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
398 aa  96.3  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.42 
 
 
381 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 
386 aa  96.3  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  30.04 
 
 
423 aa  95.5  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 
360 aa  95.9  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  23.23 
 
 
439 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07651  glycosyltransferase  24.86 
 
 
365 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457452  hitchhiker  0.00512375 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  23.78 
 
 
392 aa  95.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
426 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  26.37 
 
 
430 aa  94.7  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.37 
 
 
427 aa  95.1  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  26.91 
 
 
371 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003535  glycosyltransferase  26.78 
 
 
394 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
381 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
438 aa  94.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 
384 aa  94.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
381 aa  94  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  27.57 
 
 
370 aa  94  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
394 aa  93.2  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 
417 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  31.14 
 
 
346 aa  93.2  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
377 aa  92.8  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
385 aa  92.8  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  25.38 
 
 
406 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 
439 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 
439 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
439 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.84 
 
 
381 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  27.84 
 
 
381 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  27.84 
 
 
381 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
424 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.84 
 
 
381 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  27.84 
 
 
381 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  28.03 
 
 
468 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
435 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
426 aa  92.4  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
364 aa  92.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.84 
 
 
381 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 
398 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
394 aa  91.7  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>