More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003535 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003535  glycosyltransferase  100 
 
 
394 aa  818    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02226  hypothetical protein  77.66 
 
 
394 aa  658    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  38.42 
 
 
426 aa  298  8e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
385 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 
398 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
383 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 
750 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3115  group 1 glycosyl transferase  28.93 
 
 
374 aa  104  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 
373 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  33.17 
 
 
343 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.59 
 
 
419 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
417 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1045  group 1 glycosyl transferase  28.46 
 
 
353 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000151909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
417 aa  99.8  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  22.89 
 
 
361 aa  99.4  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
369 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  26.13 
 
 
371 aa  99  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
371 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1502  glycosyltransferase  27.16 
 
 
379 aa  97.1  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00660  glycosyltransferase  25.6 
 
 
343 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.78 
 
 
367 aa  94.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
382 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
739 aa  94.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
380 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.68 
 
 
373 aa  93.2  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 
371 aa  93.2  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.64 
 
 
381 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  23.65 
 
 
398 aa  92  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
391 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
380 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.51 
 
 
381 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
381 aa  91.3  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
355 aa  90.9  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  23.93 
 
 
387 aa  90.9  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
398 aa  90.9  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.82 
 
 
381 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  35.67 
 
 
396 aa  90.5  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
383 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 
370 aa  89.7  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
376 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
373 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
440 aa  89.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.51 
 
 
381 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  23.51 
 
 
381 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  23.51 
 
 
381 aa  89  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1139  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
366 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0404734  normal  0.023827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.51 
 
 
381 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  23.51 
 
 
381 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2836  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
381 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0535409  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.51 
 
 
381 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
391 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3016  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 
373 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
390 aa  87.4  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 
353 aa  87.4  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
395 aa  87  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  24.37 
 
 
408 aa  87  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
391 aa  86.3  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
365 aa  86.3  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 
370 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  24 
 
 
346 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
390 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  29.62 
 
 
385 aa  84  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0185  glycosyl tranferase  22.83 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.472574  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.9 
 
 
394 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
393 aa  84  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0238  glycosyl tranferase  22.83 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.93 
 
 
365 aa  83.6  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.08 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
421 aa  83.2  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  28.93 
 
 
370 aa  83.2  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
414 aa  82.8  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 
822 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  22.76 
 
 
381 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
378 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
410 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
819 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
376 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  23.32 
 
 
745 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
395 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.89 
 
 
407 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 
360 aa  82  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0598  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 
385 aa  82  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
425 aa  82  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0405  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  29 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>