More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02226 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003535  glycosyltransferase  77.66 
 
 
394 aa  658    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02226  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  817    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  38.18 
 
 
426 aa  287  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  24.13 
 
 
361 aa  109  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
398 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 
417 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
371 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.75 
 
 
367 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 
371 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
417 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  31.11 
 
 
343 aa  99.8  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 
383 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
385 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3115  group 1 glycosyl transferase  27.93 
 
 
374 aa  96.3  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.67 
 
 
419 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  27.49 
 
 
400 aa  93.6  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
365 aa  93.2  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  24.76 
 
 
373 aa  92.8  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 
377 aa  92.8  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 
387 aa  92.8  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
750 aa  92.8  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  24.25 
 
 
745 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1502  glycosyltransferase  26.93 
 
 
379 aa  91.3  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
378 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  24.34 
 
 
373 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.28 
 
 
394 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  25 
 
 
371 aa  89.7  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  23.47 
 
 
398 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
819 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
377 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.94 
 
 
381 aa  89  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
822 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.9 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 
381 aa  88.2  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
369 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
739 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
364 aa  87.8  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 
370 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 
360 aa  87.8  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.2 
 
 
373 aa  87.4  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.21 
 
 
381 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.9 
 
 
381 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  23.9 
 
 
381 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  23.9 
 
 
381 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0238  glycosyl tranferase  24.7 
 
 
343 aa  87.4  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
396 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  23.9 
 
 
381 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.9 
 
 
381 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0185  glycosyl tranferase  24.7 
 
 
343 aa  87.4  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.472574  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
390 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.9 
 
 
381 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
410 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
821 aa  86.3  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
372 aa  86.3  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
818 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.33 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  29.44 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
821 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1045  group 1 glycosyl transferase  27.64 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000151909  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2228  putative first mannosyl transferase, WbaZ  31.22 
 
 
820 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0572905 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  25.08 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00660  glycosyltransferase  24.28 
 
 
343 aa  84  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.5 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3845  group 1 glycosyl transferase  28.27 
 
 
411 aa  83.6  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452091  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  24.23 
 
 
388 aa  83.2  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 
360 aa  82.8  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
396 aa  82.8  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
382 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  24.5 
 
 
408 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 
439 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 
439 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
395 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  23.41 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  23.98 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
439 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0405  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 
351 aa  80.9  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  22.77 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.02 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  27.68 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 
395 aa  80.5  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  31.31 
 
 
425 aa  80.5  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.96 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  21.65 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
438 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2836  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0535409  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  32 
 
 
468 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 
373 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>