More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1661 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  100 
 
 		 419 aa  847    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  41.25 
 
 		 377 aa  246  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  39.11 
 
 		 376 aa  241  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  38.28 
 
 		 407 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  36.73 
 
 		 415 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2757  glycosyl transferase group 1  33.95 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  29.22 
 
 		 358 aa  110  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 		 390 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4101  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  30.79 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 		 390 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  36.94 
 
 		 382 aa  101  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1664  glycosyl transferase  28.05 
 
 		 378 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2660  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 		 389 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 		 446 aa  100  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 		 372 aa  99.8  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1155  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  31.06 
 
 		 399 aa  99.4  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 392 aa  98.2  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 		 393 aa  98.2  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 		 398 aa  98.2  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2695  glycosyl transferase, group 1  29.5 
 
 		 378 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 385 aa  96.3  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1413  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.71517 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  28.46 
 
 		 935 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 		 355 aa  94.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 		 419 aa  94  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 		 419 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 		 387 aa  94  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3090  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 		 380 aa  93.6  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251732  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.48 
 
 		 359 aa  92.8  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.58 
 
 		 371 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 		 361 aa  92.8  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0852  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  33 
 
 		 390 aa  92  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 371 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 		 401 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  33.92 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1808  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 		 397 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4401  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 		 385 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 		 436 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  28.48 
 
 		 448 aa  90.5  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 377 aa  90.5  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  33.85 
 
 		 384 aa  90.1  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 382 aa  90.1  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 		 380 aa  89.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2683  glycosyl transferase, group 1  29.4 
 
 		 384 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0254204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  26.35 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 382 aa  89.4  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5390  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3269  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 		 374 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  25.87 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 		 419 aa  88.2  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 364 aa  88.2  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 		 371 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 		 304 aa  87.8  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.87 
 
 		 366 aa  87.4  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 		 387 aa  87  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 		 396 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 		 397 aa  87  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  27.41 
 
 		 383 aa  86.7  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 415 aa  86.7  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 		 370 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 		 379 aa  86.7  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  29.22 
 
 		 430 aa  86.7  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 		 415 aa  86.3  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 		 398 aa  86.3  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  22.41 
 
 		 410 aa  86.3  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 		 403 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2711  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 		 399 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2956  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 		 468 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  28.62 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  28.8 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>