More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1022 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1022  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  847    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4272  glycosyl transferase, group 1  29.4 
 
 		 428 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.553747  normal  0.320513 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1432  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.14 
 
 		 427 aa  154  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.285066  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0228  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 		 407 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3655  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2505  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 		 409 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2188  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 418 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.777169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4368  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0158935  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 		 387 aa  97.1  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 394 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1702  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 		 406 aa  95.5  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  35.94 
 
 		 748 aa  94.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 		 346 aa  94.4  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 		 360 aa  94  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 		 372 aa  93.6  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 357 aa  92  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 		 439 aa  92  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03941  putative glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 		 421 aa  90.9  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 		 387 aa  89.7  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4365  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 		 422 aa  89.7  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.893788 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  32.7 
 
 		 405 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 		 402 aa  89.4  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  30.36 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  32.85 
 
 		 367 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  34.76 
 
 		 426 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 422 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 		 415 aa  87  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 		 362 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  21.85 
 
 		 406 aa  86.3  8e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 		 373 aa  86.3  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  32.52 
 
 		 413 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 		 373 aa  86.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  32.3 
 
 		 404 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  32.6 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  37.14 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  36.3 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  31.9 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2954  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 		 904 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  32.29 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  31.19 
 
 		 426 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  28.7 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  29.33 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.02 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 		 476 aa  81.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  30.6 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  27.38 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  37.8 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0393  putative glycosyl transferase, group 1  24.05 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.336091  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3504  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.41 
 
 		 367 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2892  a-glycosyltransferase  22.44 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000152395  normal  0.0283298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  34.83 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.16 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.69 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  35.19 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>