More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4368 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4368  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
420 aa  879    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0158935  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4365  glycosyl transferase group 1  51.9 
 
 
422 aa  450  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.893788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2188  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
418 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.777169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1702  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2505  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
409 aa  153  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1432  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.67 
 
 
427 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.285066  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2892  a-glycosyltransferase  24.65 
 
 
409 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000152395  normal  0.0283298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1022  hypothetical protein  26.51 
 
 
417 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  32.4 
 
 
360 aa  88.2  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3655  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
442 aa  84  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4272  glycosyl transferase, group 1  24.02 
 
 
428 aa  77  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.553747  normal  0.320513 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  32.68 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.54 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
357 aa  74.3  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 
440 aa  73.2  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  34.72 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  34.72 
 
 
405 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.61 
 
 
407 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
411 aa  72  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  33.58 
 
 
407 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  26.82 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  37.82 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  30.06 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
382 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.91 
 
 
404 aa  69.7  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1143  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 
404 aa  69.7  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0957  glycosyl transferase, group 1  21.59 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.599861  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1131  glycosyltransferase  31.61 
 
 
467 aa  67.8  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00129132  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
403 aa  67.4  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 
392 aa  67  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2630  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
438 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451665  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 
411 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
355 aa  66.2  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 
372 aa  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
400 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  23.34 
 
 
400 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
409 aa  66.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
423 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.29 
 
 
377 aa  66.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  28.3 
 
 
321 aa  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
377 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 
391 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.16 
 
 
400 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
402 aa  65.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 
439 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
400 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  29.17 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 
439 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
439 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
382 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
356 aa  64.3  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
391 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
409 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  23.05 
 
 
350 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
360 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
385 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
366 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  25 
 
 
366 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0854  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 
404 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0579816 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
377 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
388 aa  63.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.41 
 
 
366 aa  63.5  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  32.03 
 
 
381 aa  63.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
756 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  31.3 
 
 
378 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
371 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.24 
 
 
385 aa  63.2  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1006  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
382 aa  63.2  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.79 
 
 
406 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  25.11 
 
 
366 aa  63.2  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
363 aa  63.2  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.27 
 
 
380 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0586  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.07 
 
 
365 aa  63.2  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000129984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.11 
 
 
366 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  24.66 
 
 
366 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 
394 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  22.49 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  20.62 
 
 
372 aa  62.4  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5634  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.8 
 
 
473 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.27 
 
 
406 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 
386 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  25.21 
 
 
406 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 
393 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2434  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
503 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.27 
 
 
380 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 
461 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
426 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>