More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4365 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4365  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
422 aa  882    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.893788 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4368  glycosyl transferase group 1  51.9 
 
 
420 aa  450  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0158935  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2505  glycosyl transferase, group 1  32.22 
 
 
409 aa  153  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1702  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
406 aa  147  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2188  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 
418 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.777169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1432  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.11 
 
 
427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.285066  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2892  a-glycosyltransferase  23.24 
 
 
409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000152395  normal  0.0283298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1022  hypothetical protein  25.56 
 
 
417 aa  89.7  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3655  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 
442 aa  80.9  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
409 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4272  glycosyl transferase, group 1  24.31 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.553747  normal  0.320513 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 
439 aa  73.2  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06690  glycosyltransferase  25.54 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.57 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 
353 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  25.16 
 
 
372 aa  69.7  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  26.92 
 
 
415 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
756 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0217  glycosyltransferase  32.12 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
384 aa  67  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
417 aa  67  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
383 aa  67  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
412 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
406 aa  66.6  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  28.79 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0228  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 
407 aa  66.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219003  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1006  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
382 aa  66.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
402 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 
364 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  29.23 
 
 
803 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  32.22 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1345  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 
398 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.44 
 
 
388 aa  65.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1460  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.57 
 
 
374 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114403  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
819 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  33.78 
 
 
419 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1496  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 
374 aa  64.7  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  22.69 
 
 
378 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
393 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.67 
 
 
409 aa  63.9  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
346 aa  64.3  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
369 aa  64.3  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.37 
 
 
356 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
400 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 
395 aa  63.9  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
381 aa  63.9  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 
406 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 
370 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  22.93 
 
 
401 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1798  glycosyltransferase  26.09 
 
 
391 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
812 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  22.9 
 
 
394 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
422 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
411 aa  62.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
356 aa  62  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 
426 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 
386 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
386 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.11 
 
 
407 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
370 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
421 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  28.72 
 
 
654 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0483  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
370 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.27 
 
 
382 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1143  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
404 aa  61.6  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.65 
 
 
382 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
452 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.61 
 
 
404 aa  61.6  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1997  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
383 aa  61.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.336344 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 
364 aa  61.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  29.51 
 
 
390 aa  61.6  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  25.13 
 
 
321 aa  61.2  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 
379 aa  61.6  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 
385 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  21.25 
 
 
385 aa  61.6  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
357 aa  61.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.19 
 
 
365 aa  60.8  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
350 aa  60.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  23.79 
 
 
398 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
398 aa  61.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
439 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
438 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 
395 aa  60.8  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>