More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2892 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2892  a-glycosyltransferase  100 
 
 
409 aa  842    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000152395  normal  0.0283298 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2505  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
409 aa  186  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1702  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
406 aa  169  9e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2188  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
418 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.777169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4368  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 
420 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0158935  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4365  glycosyl transferase group 1  23.24 
 
 
422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.893788 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1432  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.99 
 
 
427 aa  90.5  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.285066  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1022  hypothetical protein  22.44 
 
 
417 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 
353 aa  76.3  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 
446 aa  73.6  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2978  glycosyltransferase-like protein  27.93 
 
 
357 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3655  glycosyl transferase, group 1  23.02 
 
 
442 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0584  putative glycosyltransferase  30.77 
 
 
353 aa  71.6  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.914213  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  23.17 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.11 
 
 
409 aa  68.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  35.57 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  33.12 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
415 aa  66.2  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4272  glycosyl transferase, group 1  20.09 
 
 
428 aa  66.2  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.553747  normal  0.320513 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  25.63 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
416 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9135  putative glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 
356 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.780016  normal  0.822205 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
420 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 
420 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 
406 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0381  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
367 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4987  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
363 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  28.73 
 
 
769 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 
440 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 
419 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  25.7 
 
 
373 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 
367 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
414 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  25.11 
 
 
376 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
387 aa  64.7  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
419 aa  64.7  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1176  glycosyl transferase, group 1  26.6 
 
 
349 aa  64.3  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
382 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4938  glycosyl transferase, putative  31.88 
 
 
379 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
417 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
356 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 
388 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2314  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
347 aa  63.9  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.055827  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
422 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  23.25 
 
 
392 aa  63.5  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
422 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4810  glycosyl transferase, group 1  31.88 
 
 
363 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
362 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 
367 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 
410 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 
389 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  24.09 
 
 
364 aa  63.2  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  21.86 
 
 
419 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  25.57 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.19 
 
 
407 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
378 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1310  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 
364 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
378 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 
408 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
417 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
422 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 
382 aa  62  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
396 aa  62  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  23.28 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  24.7 
 
 
369 aa  62.4  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
390 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
390 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
398 aa  61.6  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1744  glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 
343 aa  61.2  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 
361 aa  60.8  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
419 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  28.99 
 
 
440 aa  60.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
386 aa  60.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2801  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
393 aa  60.5  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  25.36 
 
 
344 aa  60.5  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 
407 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
390 aa  60.5  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  35.25 
 
 
362 aa  60.1  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 
756 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  24.27 
 
 
413 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1209  putative glycosyltransferase  35.4 
 
 
362 aa  60.1  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2084  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
390 aa  60.1  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.573542 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2705  glycosyl transferase group 1  36.17 
 
 
803 aa  60.1  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0869  a-glycosyltransferase  41.56 
 
 
358 aa  60.1  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.746857  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0775  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 
345 aa  60.1  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0449927  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
395 aa  59.7  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 
426 aa  59.7  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 
348 aa  59.7  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>