More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2801 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2801  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
393 aa  806    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5790  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
376 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3338  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
415 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.620464  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6700  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2585  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
388 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  0.530057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0254  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
389 aa  106  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.401969  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13791  hypothetical protein  24.51 
 
 
389 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0869  a-glycosyltransferase  25.29 
 
 
358 aa  101  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.746857  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2469  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
380 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
387 aa  87.8  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0823  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5134  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3861  putative glycosyltransferase  29.39 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  29.19 
 
 
389 aa  79.7  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
810 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  34.93 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 
403 aa  76.3  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  33.68 
 
 
803 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 
440 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5854  putative glycosyl transferase  27.12 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707632  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
355 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  38.69 
 
 
871 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  33.99 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  29.67 
 
 
373 aa  72  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5501  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
378 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205399  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.31 
 
 
390 aa  71.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 
394 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  34.74 
 
 
468 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  35.16 
 
 
364 aa  70.1  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  35.65 
 
 
1177 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10227  hypothetical protein  29.05 
 
 
384 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.990297  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  33.76 
 
 
419 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  33.1 
 
 
386 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
820 aa  68.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.19 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
1177 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  39.05 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  35.48 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1432  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.4 
 
 
427 aa  67.8  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.285066  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2454  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  29.59 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0426  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  31.89 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5490  glycosyl transferase group 1  37.41 
 
 
402 aa  67.4  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 
476 aa  67.4  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 
367 aa  67  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2088  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  29.47 
 
 
400 aa  67  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6087  glycosyl transferase group 1  37.68 
 
 
394 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0801874  hitchhiker  0.00307291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  28.09 
 
 
375 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  40.4 
 
 
364 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 
816 aa  66.6  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1159  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.35 
 
 
346 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.278047  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.85 
 
 
383 aa  66.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  29.56 
 
 
388 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 
536 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
376 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1470  Glycosyltransferase-like protein  32.69 
 
 
440 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.5 
 
 
380 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1590  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
468 aa  65.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00816719  decreased coverage  0.0063014 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
361 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.19 
 
 
380 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
396 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
362 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 
402 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.08 
 
 
409 aa  65.1  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.16 
 
 
392 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  36.61 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  36.61 
 
 
364 aa  65.1  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 
427 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  22.17 
 
 
388 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1108  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 
357 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0280638  normal  0.0326528 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 
363 aa  64.7  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 
425 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  35.04 
 
 
386 aa  65.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.16 
 
 
392 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 
378 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  31.76 
 
 
375 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  25.29 
 
 
347 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.16 
 
 
420 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.16 
 
 
420 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>