More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3655 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3655  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 442 aa  893    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4272  glycosyl transferase, group 1  57.35 
 
 		 428 aa  455  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.553747  normal  0.320513 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1432  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.25 
 
 		 427 aa  160  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.285066  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1022  hypothetical protein  27.29 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1702  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2505  glycosyl transferase, group 1  30.75 
 
 		 409 aa  109  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2188  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 418 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.777169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0228  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 		 407 aa  89.7  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4365  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 422 aa  89.7  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.893788 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4368  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 		 420 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0158935  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2892  a-glycosyltransferase  22.45 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000152395  normal  0.0283298 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 		 756 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  34.85 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  28.67 
 
 		 392 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  33.33 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3644  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 		 478 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102527  decreased coverage  0.0000773484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0727  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 		 382 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0832639  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 440 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  26.06 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  36.62 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  34.72 
 
 		 773 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0254  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.401969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.92 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  38.61 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  37.23 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  32.22 
 
 		 353 aa  63.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 		 397 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 		 871 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1496  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  23.03 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  33.16 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.07 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4579  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2541  group 1 glycosyl transferase  25.4 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.433843  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  31.64 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1247  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.174724  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1345  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0854  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0579816 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06690  glycosyltransferase  31.94 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6735  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  38.85 
 
 		 742 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2436  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  33.49 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2385  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04591  putative glycosyl transferase, group 1  22.95 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1086  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0607003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  29.02 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 		 810 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  40.15 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  37.39 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1934  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  32.43 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 		 639 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0957  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.599861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  27 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.71 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  22.89 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.68 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0969  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0289786  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.32 
 
 		 380 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  23.32 
 
 		 380 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2939  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 384 aa  57  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.808292 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 		 399 aa  57  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  35.61 
 
 		 368 aa  57  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  28.69 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>