More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0969 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0969  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
395 aa  810    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0289786  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2794  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
404 aa  186  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2253  hypothetical protein  27.06 
 
 
386 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0192058  hitchhiker  0.00258376 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
463 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 
417 aa  109  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 
481 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
392 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
419 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  22.98 
 
 
428 aa  102  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
457 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 
414 aa  93.2  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
387 aa  87  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6558  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
458 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 
441 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  23 
 
 
517 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  24.13 
 
 
416 aa  77.8  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  23.65 
 
 
427 aa  76.6  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  22.74 
 
 
810 aa  76.6  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
370 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  21.39 
 
 
395 aa  74.3  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
418 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  23.6 
 
 
476 aa  73.9  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5490  glycosyl transferase group 1  24.01 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  22.9 
 
 
419 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 
408 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2282  glycosyl transferase, group 1  26.57 
 
 
386 aa  72.4  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 
393 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
391 aa  72  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
414 aa  70.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  28.63 
 
 
414 aa  70.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  22.87 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  21.96 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  23.32 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.92 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  23.76 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0470  glycosyl transferase group 1  23.45 
 
 
456 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 
415 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  21.93 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  21.67 
 
 
407 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  23.19 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  22.59 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  24.5 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  26.21 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
403 aa  67.8  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  23.19 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  22.3 
 
 
402 aa  67  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
397 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  23.74 
 
 
436 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  21.61 
 
 
416 aa  66.6  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  22.73 
 
 
406 aa  66.6  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
385 aa  66.2  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
386 aa  66.2  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  22.26 
 
 
819 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  23.88 
 
 
346 aa  65.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.16 
 
 
382 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3400  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.41 
 
 
423 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 
385 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  23.23 
 
 
377 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4958  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
822 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0651584  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0801  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
388 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  29.31 
 
 
382 aa  64.7  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
390 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
360 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02965  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative glycosyltransferase  25.19 
 
 
388 aa  64.7  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147492  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2878  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 
380 aa  64.3  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  22.74 
 
 
446 aa  63.9  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  23.21 
 
 
391 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
372 aa  64.3  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  22.78 
 
 
812 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3484  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
379 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
415 aa  63.5  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
353 aa  63.5  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
452 aa  63.5  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
390 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 
413 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1825  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
353 aa  63.2  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4448  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 
428 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
379 aa  62.8  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  21.48 
 
 
389 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  25.29 
 
 
420 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
421 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 
360 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00636  hypothetical protein similar to phosphatidylinositol:UDP-GlcNAc transferase PIG-A (Broad)  22.16 
 
 
488 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0909226  normal  0.40959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 
386 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>