More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3221 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
417 aa  852    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  63.14 
 
 
419 aa  519  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  48.08 
 
 
392 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  41.97 
 
 
463 aa  320  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  39.8 
 
 
428 aa  315  6e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  41.12 
 
 
414 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6558  glycosyl transferase group 1  41.86 
 
 
458 aa  293  5e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  39.75 
 
 
457 aa  288  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  39.05 
 
 
445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  39.68 
 
 
481 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2794  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8511  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0190173 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0969  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 
395 aa  109  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0289786  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2253  hypothetical protein  22.28 
 
 
386 aa  97.4  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0192058  hitchhiker  0.00258376 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 
417 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
409 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
395 aa  87  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 
434 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  23.18 
 
 
405 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
408 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 
406 aa  80.5  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  22.45 
 
 
419 aa  80.1  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 
412 aa  79.7  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  24.03 
 
 
433 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
394 aa  77  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 
366 aa  77  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  33.33 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  22.28 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  26.46 
 
 
564 aa  74.7  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  25.95 
 
 
723 aa  74.3  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  25.06 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  22.89 
 
 
394 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  23.33 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0334  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.145244 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
405 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  22.94 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  23.99 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.91 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  24.07 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  24.01 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  23.43 
 
 
407 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 
415 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  24.41 
 
 
416 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  22.84 
 
 
517 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  26.25 
 
 
420 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  26.1 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  23.33 
 
 
416 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  24.42 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  24.67 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4414  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63782  normal  0.431195 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0135  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
404 aa  66.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.2 
 
 
408 aa  66.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
399 aa  65.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  26.99 
 
 
414 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
414 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  23.57 
 
 
394 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
402 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
395 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 
374 aa  64.7  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
360 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  22.78 
 
 
421 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1684  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 
409 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
417 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 
410 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  24.17 
 
 
382 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  23.33 
 
 
397 aa  64.3  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  20.63 
 
 
407 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
410 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  26.12 
 
 
415 aa  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.11 
 
 
403 aa  63.5  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 
382 aa  63.5  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
409 aa  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
422 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0201  glycosyl transferase group 1  23.22 
 
 
399 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00670088  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 
378 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  22.96 
 
 
404 aa  63.2  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  24.78 
 
 
386 aa  63.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  24.64 
 
 
432 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  21.72 
 
 
408 aa  62.4  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 
378 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  24.47 
 
 
405 aa  62.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  23.77 
 
 
366 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
417 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  35.25 
 
 
467 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  24.42 
 
 
403 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>