More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6558 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6558  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 458 aa  931    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  69.59 
 
 		 463 aa  625  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  55.58 
 
 		 481 aa  437  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  52.39 
 
 		 445 aa  428  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  50.94 
 
 		 457 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  48.59 
 
 		 414 aa  362  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  46.6 
 
 		 419 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  45.9 
 
 		 392 aa  316  6e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  41.86 
 
 		 417 aa  315  8e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  41.16 
 
 		 428 aa  310  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2794  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8511  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0190173 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 405 aa  100  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0969  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0289786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 		 394 aa  96.3  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 		 409 aa  94.4  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 		 393 aa  90.1  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 		 394 aa  90.1  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.59 
 
 		 403 aa  88.2  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 397 aa  88.2  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 		 405 aa  88.2  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  26.48 
 
 		 433 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  29.22 
 
 		 434 aa  87.8  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2253  hypothetical protein  22.59 
 
 		 386 aa  87.8  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0192058  hitchhiker  0.00258376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4414  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63782  normal  0.431195 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  27.99 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  30.04 
 
 		 564 aa  75.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  26.32 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  23.95 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  20.46 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 392 aa  72  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0334  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.145244 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  23.62 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 405 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3120  glycosyl transferase, group 1  22.94 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  22.78 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  29.85 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.9 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.18 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  23.12 
 
 		 404 aa  67  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  22 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  29.1 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  29.1 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0241  glycosyl transferase group 1  21.91 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.514608  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 		 385 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  29.58 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  18.88 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1691  glycosyl transferase, group 1  25.17 
 
 		 550 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  24.26 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  22.63 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0666  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000035657 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0135  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 		 425 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  24.47 
 
 		 935 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  23.48 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 		 536 aa  57.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  22.55 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  31.74 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 		 904 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  27.82 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  21.56 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1064  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 		 457 aa  57  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 		 406 aa  57  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 		 378 aa  57  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  23.97 
 
 		 388 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  24.81 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1689  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 		 540 aa  56.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.224017  hitchhiker  0.00115774 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  25.2 
 
 		 401 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 859 aa  55.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  21.86 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  30.83 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>