More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0624 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 		 383 aa  776    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  77.37 
 
 		 409 aa  610  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  63.71 
 
 		 397 aa  526  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  63.42 
 
 		 434 aa  503  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  60.21 
 
 		 394 aa  472  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  59.95 
 
 		 393 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  59.21 
 
 		 394 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  45.8 
 
 		 417 aa  340  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4414  glycosyl transferase, group 1  47.51 
 
 		 397 aa  318  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63782  normal  0.431195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0334  glycosyl transferase group 1  50.29 
 
 		 411 aa  315  8e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.145244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  46.25 
 
 		 405 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  45.88 
 
 		 405 aa  311  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  26.65 
 
 		 394 aa  123  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  26.82 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  31.85 
 
 		 406 aa  113  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  30.06 
 
 		 405 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  27.21 
 
 		 401 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 		 405 aa  99.4  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  26.36 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  32.74 
 
 		 403 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  28.2 
 
 		 405 aa  97.1  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.49 
 
 		 405 aa  96.7  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 		 419 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 		 416 aa  93.6  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  34.33 
 
 		 768 aa  92  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  27.56 
 
 		 723 aa  92.4  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 405 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 		 419 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 		 439 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 		 436 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 		 439 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 		 439 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 		 417 aa  89.7  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  27.22 
 
 		 569 aa  89.4  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  26.33 
 
 		 557 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  34.18 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 463 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 438 aa  87.4  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 		 422 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  36.32 
 
 		 389 aa  86.3  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08970  glycosyltransferase  33.23 
 
 		 601 aa  85.5  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  28.57 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 		 448 aa  84.3  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 672 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  29.58 
 
 		 564 aa  81.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 		 440 aa  80.1  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 		 348 aa  79  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  28.54 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 904 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  26.62 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  27.59 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 		 575 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.3 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1825  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  24.47 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  31.89 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 411 aa  76.3  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 		 386 aa  76.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>