More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2473 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  85.11 
 
 		 403 aa  653    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 403 aa  792    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  53.88 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0066  glycosyl transferase group 1  49.63 
 
 		 403 aa  299  6e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.918731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  34.25 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  38.6 
 
 		 415 aa  109  9.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  35.93 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 		 394 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  36.51 
 
 		 475 aa  100  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  35.1 
 
 		 372 aa  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  34.01 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  36.36 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 		 405 aa  86.7  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  27.27 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  30.06 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0777  glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 		 384 aa  82.8  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.135676  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.79 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0355  glycosyl transferase, group 1  22.72 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  30.31 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  30.63 
 
 		 723 aa  80.9  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  21.23 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  25.13 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  38.01 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  34.57 
 
 		 569 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.27 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1098  glycosyl transferase, group 1  37.25 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000174452 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  34.39 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  23.53 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2192  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  34.98 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  34.69 
 
 		 557 aa  73.2  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  29.93 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2254  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0723451 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  37.28 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.79 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.79 
 
 		 495 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.79 
 
 		 499 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.79 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.25 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.25 
 
 		 498 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.25 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  31.92 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  33.48 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1365  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  37.14 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 535 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  31.91 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  31.36 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 		 575 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7635  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 		 507 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212629  normal  0.696625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>