More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3449 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 394 aa  804    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  96.88 
 
 		 393 aa  768    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  63.8 
 
 		 409 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  59.95 
 
 		 397 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  58.07 
 
 		 434 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  60.21 
 
 		 383 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  54.66 
 
 		 394 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  44.22 
 
 		 417 aa  328  7e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  44.9 
 
 		 405 aa  322  9.000000000000001e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4414  glycosyl transferase, group 1  43.94 
 
 		 397 aa  315  7e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63782  normal  0.431195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  42.36 
 
 		 405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0334  glycosyl transferase group 1  46.86 
 
 		 411 aa  300  4e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.145244 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  27.03 
 
 		 394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  25.08 
 
 		 416 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 		 445 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  25.91 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 		 403 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  36.28 
 
 		 403 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 		 386 aa  97.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 		 405 aa  95.9  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  30.51 
 
 		 723 aa  95.5  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 		 406 aa  94.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 		 372 aa  92.4  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 392 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  27.39 
 
 		 404 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 405 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  23.01 
 
 		 348 aa  91.3  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  28.25 
 
 		 413 aa  89.4  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 		 463 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 		 481 aa  87.8  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 		 386 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  26.45 
 
 		 569 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  26.11 
 
 		 557 aa  87  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 385 aa  86.7  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 		 375 aa  86.7  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 		 371 aa  86.3  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 		 418 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  24.69 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 		 575 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  34.09 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0231  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1099  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 419 aa  79.7  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 		 402 aa  79.3  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2841  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  24.84 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2857  group 1 glycosyl transferase  25.48 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  26.62 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27990  glycosyltransferase  27.61 
 
 		 603 aa  77.8  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  23.68 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  31.7 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 		 904 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  24.47 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 		 819 aa  77  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  22.69 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2192  glycosyl transferase group 1  23.32 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 		 396 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 373 aa  76.3  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  25.43 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0160  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  25.58 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2254  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0723451 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  24.27 
 
 		 475 aa  75.1  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>