More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3851 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
575 aa  1120    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  50.63 
 
 
557 aa  343  7e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  48.73 
 
 
564 aa  326  8.000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  45.92 
 
 
569 aa  323  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27990  glycosyltransferase  40.48 
 
 
603 aa  251  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08970  glycosyltransferase  45.14 
 
 
601 aa  246  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  41.47 
 
 
1188 aa  243  5e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26850  glycosyltransferase  45.38 
 
 
573 aa  238  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  37.02 
 
 
405 aa  220  7e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  35.64 
 
 
401 aa  212  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  38.25 
 
 
405 aa  208  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  36.3 
 
 
406 aa  204  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  37.41 
 
 
411 aa  202  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  36 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  34.89 
 
 
405 aa  194  5e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  32.1 
 
 
723 aa  186  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  34.57 
 
 
406 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  34.2 
 
 
416 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  36.75 
 
 
402 aa  179  9e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4821  glycosyl transferase, group 1  37.14 
 
 
401 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726751  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  36.93 
 
 
768 aa  140  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0635  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
403 aa  134  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  36.01 
 
 
415 aa  121  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  36.02 
 
 
414 aa  113  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  36.02 
 
 
414 aa  113  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  35.25 
 
 
374 aa  107  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1851  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.11 
 
 
400 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
412 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4282  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
396 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
475 aa  99.8  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  33.66 
 
 
386 aa  97.8  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
360 aa  97.4  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
392 aa  95.9  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
535 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
417 aa  92  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  28.17 
 
 
371 aa  91.7  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 
351 aa  91.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  33.19 
 
 
378 aa  91.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
360 aa  91.3  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
418 aa  90.9  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 
409 aa  90.9  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 
393 aa  90.9  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  36.67 
 
 
377 aa  90.5  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  28.61 
 
 
426 aa  89  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
439 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 
439 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 
439 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  34.93 
 
 
399 aa  88.6  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  25.75 
 
 
394 aa  87.8  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  27.58 
 
 
904 aa  87.8  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
430 aa  87  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 
399 aa  86.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  40.45 
 
 
381 aa  86.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  30.54 
 
 
380 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  35.12 
 
 
376 aa  86.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  38.64 
 
 
654 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2282  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
386 aa  86.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
413 aa  85.9  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  28.69 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
390 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 
414 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
393 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
438 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 
476 aa  85.1  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  35.19 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
390 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 
370 aa  84  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  31.2 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  25.09 
 
 
397 aa  84  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
372 aa  83.2  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 
375 aa  83.2  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
403 aa  82.4  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
379 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 
409 aa  82  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0737  glycosyl transferase-like  38 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  34.74 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  25.35 
 
 
416 aa  81.6  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  34.94 
 
 
426 aa  80.9  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  31.06 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  34.82 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
477 aa  80.5  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 
435 aa  80.5  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
438 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
389 aa  80.1  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
539 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 
397 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
402 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
371 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
438 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 
517 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>