More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0635 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0635  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 403 aa  823    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1851  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.86 
 
 		 400 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 		 411 aa  180  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 		 405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4282  glycosyl transferase, group 1  30.9 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  31.63 
 
 		 416 aa  169  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 406 aa  168  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 		 405 aa  156  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 		 405 aa  155  9e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  29.5 
 
 		 406 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4821  glycosyl transferase, group 1  32.68 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726751  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 		 401 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 		 402 aa  150  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  31.02 
 
 		 723 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 575 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  30.19 
 
 		 557 aa  130  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  29.64 
 
 		 569 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  28.44 
 
 		 564 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  29.79 
 
 		 1188 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27990  glycosyltransferase  27.36 
 
 		 603 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08970  glycosyltransferase  31.26 
 
 		 601 aa  109  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  26.65 
 
 		 650 aa  99  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  30.18 
 
 		 382 aa  94  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26850  glycosyltransferase  27.25 
 
 		 573 aa  91.7  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 		 435 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 		 376 aa  87  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 		 768 aa  85.5  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  22.94 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  27.27 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  23.27 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 672 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  24.05 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1098  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000174452 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  22.96 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0545  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  22.15 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  31.3 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.95 
 
 		 495 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.95 
 
 		 499 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.95 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.95 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.95 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.95 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.95 
 
 		 498 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  23.24 
 
 		 935 aa  73.6  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  21.55 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  24.2 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  26.38 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 904 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  22.79 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  27.39 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  23.42 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 		 433 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 		 439 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 		 439 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  23.24 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  22.19 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0964  glycosyl transferase, group 1  24.5 
 
 		 613 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>