More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1851 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1851  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
400 aa  837    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0635  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
403 aa  182  9.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
405 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 
406 aa  170  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4282  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
401 aa  162  7e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 
406 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 
411 aa  158  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
416 aa  157  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
402 aa  157  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 
405 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4821  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 
401 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726751  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 
405 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  25.06 
 
 
1188 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  24.7 
 
 
564 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08970  glycosyltransferase  27.16 
 
 
601 aa  111  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27990  glycosyltransferase  24.25 
 
 
603 aa  106  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  23.11 
 
 
575 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  25.06 
 
 
569 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 
768 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  25.42 
 
 
557 aa  103  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  26.71 
 
 
723 aa  103  7e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26850  glycosyltransferase  28.35 
 
 
573 aa  92.8  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
366 aa  90.5  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 
377 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  24.61 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
374 aa  77  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2878  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 
380 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305782 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.93 
 
 
388 aa  76.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0993  putative cell division protease FtsH-like protein  25.64 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2192  glycosyl transferase group 1  24.01 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.7 
 
 
385 aa  74.7  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  23.88 
 
 
430 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  22.15 
 
 
445 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  22.78 
 
 
769 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  24.69 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 
426 aa  72.8  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
372 aa  72.4  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  23.73 
 
 
396 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  23.43 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2254  glycosyl transferase group 1  24.01 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0723451 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  22.61 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  22.65 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  23.24 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 
375 aa  71.2  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.91 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  23.28 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0159  glycosyl transferase group 1  23.79 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  23.39 
 
 
441 aa  70.5  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  24.55 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  23.19 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  23.56 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  23.66 
 
 
416 aa  69.7  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  22.33 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
426 aa  69.7  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  22.4 
 
 
412 aa  69.7  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  21.25 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
417 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  21.08 
 
 
447 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  22.15 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  23.93 
 
 
403 aa  67.4  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  20.07 
 
 
389 aa  67.4  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02589  Glycosyltransferase  27.95 
 
 
403 aa  67.4  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 
415 aa  67  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  21.3 
 
 
379 aa  67  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  20.32 
 
 
475 aa  66.6  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  21.97 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  23.28 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.19 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 
417 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  21.83 
 
 
390 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.12 
 
 
366 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0852  glycosyl transferase group 1  22.42 
 
 
389 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  23.49 
 
 
401 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  20.94 
 
 
452 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  23.83 
 
 
393 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  23.96 
 
 
403 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  22.46 
 
 
386 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 
385 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 
400 aa  64.7  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0120  glycosyl transferase group 1  22.52 
 
 
393 aa  64.3  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000209107 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  23.62 
 
 
421 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
364 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0777  glycosyl transferase, group 1  22.73 
 
 
384 aa  64.7  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.135676  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 
401 aa  64.3  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  21.45 
 
 
435 aa  64.3  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.555992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>