More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1098 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1098  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
399 aa  795    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000174452 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  79.7 
 
 
402 aa  623  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2570  glycosyl transferase group 1  44.36 
 
 
402 aa  262  8.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3354  glycosyl transferase group 1  38 
 
 
409 aa  244  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2468  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 
386 aa  147  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.822544  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4448  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 
428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 
412 aa  116  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.6 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0801  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
388 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3439  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
400 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.359579  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  31.38 
 
 
569 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4880  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
393 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  31.29 
 
 
557 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3504  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
400 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0009700000000003e-28 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  32.76 
 
 
391 aa  99.8  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  35.38 
 
 
414 aa  98.6  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
416 aa  98.6  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 
414 aa  98.6  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
390 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
417 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
434 aa  95.9  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  29.44 
 
 
394 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1419  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.16 
 
 
396 aa  95.5  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 
408 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  35.09 
 
 
436 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.64 
 
 
403 aa  93.2  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 
386 aa  92.8  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
385 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
385 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
360 aa  91.3  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  29.3 
 
 
723 aa  90.9  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  26.79 
 
 
416 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
517 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 
381 aa  90.1  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 
411 aa  90.1  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  36.14 
 
 
403 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  33.48 
 
 
399 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 
411 aa  89.4  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 
441 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
376 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  35.68 
 
 
382 aa  87.8  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
360 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  27.34 
 
 
404 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  24.5 
 
 
373 aa  87.4  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
410 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
810 aa  87  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
390 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  33.97 
 
 
415 aa  87  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
397 aa  86.7  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0635  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
403 aa  86.3  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
390 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.37 
 
 
385 aa  85.9  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
414 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  32.29 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  33.6 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 
372 aa  84.3  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
387 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
397 aa  84  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  33.89 
 
 
376 aa  83.6  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 
418 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
405 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
382 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 
403 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  35.87 
 
 
399 aa  82  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  27.48 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 
408 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27990  glycosyltransferase  32.92 
 
 
603 aa  81.3  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
394 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  34.58 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
399 aa  80.9  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 
406 aa  79.7  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1684  glycosyl transferase, group 1  32.96 
 
 
409 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2899  group 1 glycosyl transferase  24.3 
 
 
390 aa  79  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00186189  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
379 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
393 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
413 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
403 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 
375 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 
426 aa  78.2  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
419 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  28.4 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
535 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  31.74 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  34.12 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>