More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1684 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1684  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 409 aa  833    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.94 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1098  glycosyl transferase, group 1  33.13 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000174452 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  22.04 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  25.29 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 		 426 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.27 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  24.28 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0324  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.546563  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  25.29 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 		 446 aa  63.2  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  27.91 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  24.71 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  22.47 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  27.56 
 
 		 723 aa  61.6  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  23.29 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0969  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0289786  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.07 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  28.73 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  22.37 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.6 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  23.28 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  24.76 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  24.51 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  27.94 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  24.36 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4496  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  27.5 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  25.25 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  24.3 
 
 		 411 aa  57  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 		 402 aa  57  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 		 1267 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 375 aa  57  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.28 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2570  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 		 402 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  28.42 
 
 		 427 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  21.78 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  22.88 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 		 365 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 364 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 		 380 aa  56.2  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  27.17 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  25.86 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 		 477 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0094  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.514117 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 		 436 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.86 
 
 		 382 aa  55.1  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.94 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 		 445 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  24.34 
 
 		 373 aa  54.7  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  23.28 
 
 		 392 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 768 aa  54.7  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 386 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.36 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  26.39 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  25.41 
 
 		 344 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>