More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2715 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 375 aa  744    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  44.27 
 
 		 396 aa  292  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  42.93 
 
 		 395 aa  285  9e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  35.09 
 
 		 378 aa  279  7e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  34.4 
 
 		 374 aa  273  3e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  40.74 
 
 		 381 aa  255  8e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  36.56 
 
 		 377 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  41.11 
 
 		 386 aa  249  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  37.47 
 
 		 379 aa  230  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  41.18 
 
 		 375 aa  218  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  37.3 
 
 		 382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  40.23 
 
 		 374 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  38.52 
 
 		 381 aa  192  6e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  36.34 
 
 		 381 aa  189  9e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 		 358 aa  182  7e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  40.22 
 
 		 359 aa  179  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0732  group 1 glycosyl transferase  37.47 
 
 		 358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0243925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  37.4 
 
 		 364 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  35.22 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  30.92 
 
 		 384 aa  159  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1369  Glycosyltransferase-like protein  34.96 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3865  glycosyl transferase group 1  37.16 
 
 		 666 aa  143  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  37.02 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5882  glycosyl transferase group 1  35.83 
 
 		 405 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 		 388 aa  129  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 		 364 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 401 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  42.36 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  40.13 
 
 		 392 aa  103  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 		 761 aa  97.1  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  34.92 
 
 		 397 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  24.29 
 
 		 797 aa  93.6  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 415 aa  93.2  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 		 767 aa  89.4  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  35.36 
 
 		 413 aa  88.6  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  37.32 
 
 		 394 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  35.44 
 
 		 443 aa  87.4  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  26.22 
 
 		 401 aa  82.8  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1349  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 		 410 aa  82.8  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.04 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 389 aa  82.8  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 377 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 		 457 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 		 780 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  21.11 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 		 789 aa  80.5  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4267  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4250  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.142252  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  22.62 
 
 		 394 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 774 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2909  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4266  glycosyl transferase, group 1  33.53 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  31.77 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4416  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1350  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1028  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.82 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  23.54 
 
 		 763 aa  76.3  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  22.6 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 		 425 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 774 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1964  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2521  putative glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329961  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1176  glycosyl transferase, group 1  34.11 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1188  glycosyl transferase, group 1  22.06 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2179  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.416488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  23.67 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>