More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4468 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
457 aa  934    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  55.36 
 
 
481 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  56.02 
 
 
445 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  55.42 
 
 
463 aa  425  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6558  glycosyl transferase group 1  50.23 
 
 
458 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  45.71 
 
 
414 aa  346  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  45.66 
 
 
392 aa  306  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  41.22 
 
 
419 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  39.75 
 
 
417 aa  288  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  35.87 
 
 
428 aa  249  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8511  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
418 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0190173 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2794  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0969  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
395 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0289786  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 
397 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 
406 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  27.43 
 
 
417 aa  94.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
385 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
409 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
410 aa  83.6  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4414  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63782  normal  0.431195 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 
434 aa  83.2  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
394 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2253  hypothetical protein  22.22 
 
 
386 aa  82  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0192058  hitchhiker  0.00258376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 
404 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
517 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 
415 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
403 aa  76.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  22.62 
 
 
430 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  20.66 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 
403 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
410 aa  72  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
370 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 
904 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  27.57 
 
 
723 aa  70.1  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  22.87 
 
 
416 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1684  glycosyl transferase, group 1  26.62 
 
 
409 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
859 aa  67.4  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  25.75 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  28.14 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.64 
 
 
403 aa  67  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.17 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 
405 aa  66.6  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  23.47 
 
 
416 aa  66.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 
414 aa  65.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
386 aa  65.1  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
575 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 
373 aa  64.7  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 
382 aa  64.7  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
405 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  26.76 
 
 
404 aa  64.3  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 
411 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
377 aa  63.5  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
409 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 
372 aa  63.9  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 
407 aa  63.5  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
386 aa  63.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 
413 aa  63.2  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 
422 aa  63.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
414 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  23.14 
 
 
401 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  25.95 
 
 
403 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
396 aa  62  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
455 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  22.3 
 
 
423 aa  62.4  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  26.79 
 
 
414 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  22.31 
 
 
415 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 
424 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  33.12 
 
 
557 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0201  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 
399 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00670088  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
458 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 
420 aa  61.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
381 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  23.02 
 
 
394 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
417 aa  60.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  24.21 
 
 
433 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  24.23 
 
 
401 aa  60.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  25.72 
 
 
402 aa  60.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  22.73 
 
 
405 aa  60.1  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 
414 aa  60.1  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  26.67 
 
 
564 aa  59.7  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
376 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  23 
 
 
417 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3169  glycosyl transferase group 1  21.64 
 
 
409 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 
446 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0646  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
430 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 
387 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 
404 aa  58.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3772  glycosyl transferase group 1  22.83 
 
 
438 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  21.51 
 
 
409 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  23.96 
 
 
410 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>