58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2253 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2253  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  799    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0192058  hitchhiker  0.00258376 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2794  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0969  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 		 395 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0289786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  21.79 
 
 		 445 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  22.28 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  21.11 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  23.94 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 		 457 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  22.43 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  22.69 
 
 		 419 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6558  glycosyl transferase group 1  22.14 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  23.3 
 
 		 481 aa  73.2  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  23.55 
 
 		 382 aa  67  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0241  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.514608  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  23.73 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  23.64 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  23.49 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  22.51 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  20.9 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  20 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  22.82 
 
 		 859 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  22.05 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  23.78 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  20.47 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 		 386 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  25.7 
 
 		 397 aa  53.9  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1851  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.08 
 
 		 400 aa  53.9  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3169  glycosyl transferase group 1  19.88 
 
 		 409 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  26.14 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4553  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.729319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 		 359 aa  50.8  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  20.89 
 
 		 418 aa  50.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  25.52 
 
 		 389 aa  49.7  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  22.13 
 
 		 373 aa  49.7  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1687  glycosyl transferase group 1  21.22 
 
 		 519 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  20.89 
 
 		 402 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  22.18 
 
 		 433 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2531  glycosyl transferase group 1  22.15 
 
 		 386 aa  47.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269278 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  20.24 
 
 		 385 aa  47  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  24.43 
 
 		 385 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  23.93 
 
 		 452 aa  47  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1690  glycosyl transferase, group 1  22.27 
 
 		 517 aa  46.6  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539973  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1139  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 		 366 aa  46.2  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0404734  normal  0.023827 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2781  a-glycosyltransferase  21.08 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27166  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  21.01 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  19.44 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  20.65 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1854  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3120  glycosyl transferase, group 1  21.14 
 
 		 372 aa  43.5  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2288  putative glycosyl transferase  23.03 
 
 		 407 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  hitchhiker  0.00856405 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  18.44 
 
 		 371 aa  43.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  21.01 
 
 		 408 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>